9.0. Ферменты
Благодаря процессам роста и деления клетка находится в состоянии непрерывной химической активности. В большинстве случаев эта активность принимает форму химической реакции между ферментом и субстратом, при этом ферменты остаются неизменными, а субстраты превращаются в другие вещества в результате разрыва или образования ковалентных связей.
Даже органические коферменты в процессе функционирования подвергаются подобным изменениям, например никотинамидаденинди- нуклеотид сначала присоединяет, а затем отщепляет атом водорода от атома углерода в положении 4. Аналогично дифос- фотиамин сначала присоединяет ацетильную группу в положение 2, а затем теряет ее.Некоторые из коферментов («кофакторов») представляют собой неорганические катионы, большинство же является простыми органическими молекулами. Однако многие ферменты не нуждаются в коферментах. Органические коферменты синтезируются либо в данном организме, либо в другом, а затем попадают в первый с пищей. Белковая часть фермента, содержащая кофермент, называется апоферментом. К субстратам относится либо сама пища, либо простые молекулы, образующиеся из нее под действием разрушающих или синтезирующих ферментов. Известно более 2000 разных ферментов. Многие из них получены в чистом виде с помощью электрофореза или еще более эффективным методом — афинной хроматографией [Dixon, Webb, 1979]. Число ферментов значительно возрастает, если включить в их ряд еще и изоферменты (разд. 4.2). Некоторые ферменты представлены в клетках лишь несколькими молекулами, другие вообще отсутствуют, но в нужный момент их синтез начинается благодаря наличию соответствующей информации, заключенной в ДНК. В то же время известны и такие ферменты, которые составляют по крайней мере 50% сухого веса клетки, примером может служить миозин (аденозин- трифосфатаза) в мышечных клетках.
До недавних пор очистка ферментов обычными методами занимала много времени, а выход чистого фермента был невелик.
Появление афинной хроматографии позволило резко ускорить этот процесс и повысить его эффективность. При ЭТОМ специфический ингибитор данного фермента связывается ковалентно с полимерным адсорбентом с помощью подвижного мостика, например группы СН2СН2. Связанный фермент с ингибитором накапливается в колонке, с которой затем его легко вымывают, изменив pH элюента [Cuatrecasas, Wilcheck, Anfin- sen, 1968].Первым синтетическим ферментом была рибонуклеаза. Ее синтезировали как в растворе, используя классические методы органического синтеза [Hirschmann et al., 1969], так и твердофазным методом Меррифилда [Gutte, Merrifield, 1969].
Для установления структуры ферментов наиболее успешно применяют метод рентгеноструктурного анализа. Самые точные результаты были получены с использованием аппаратуры с высоким разрешением (до ~0,2 нм), несмотря на то, что это достаточно дорого и занимает немало времени даже при наличии самой современной компьютерной техники. Этим методом удалось установить строение примерно 100 ферментов.
Еще по теме 9.0. Ферменты:
- 3.5. Фосфолипиды и позиционный (релейный) принцип регуляции активности ферментов
- ОВТВ, нарушающие тканевые процессы биоэнергетики. Ингибиторы ферментов цикла Кребса
- Ингибиторы цепи дыхательных ферментов
- Ферменты метилирования
- Ферменты, содержащиеся в гранулах «профессиональных фагоцитов»
- Мутации в гене LRRK2 и активность фермента
- Амилоид-деградирующие ферменты
- Регуляция свойств амилоид-деградирующих ферментов
- Ферменты процессинга Ар
- Определение ферментативной активности слизистой оболочки тонкой кишки методом ступенчатой десорбции ферментов
- АдаПТАЦИЯ ПИЩЕВАРИТЕЛЬНЫХ ФЕРМЕНТОВ
- Влияние условий культивирования на активность ключевых ферментов биосинтеза аргинина
- Мембранные каналы и переносчики как ферменты
- Глава 9 АНТИМЕТАБОЛИТЫ: АНАЛОГИ КОФЕРМЕНТОВ И СУБСТРАТОВ ФЕРМЕНТОВ, ОБЛАДАЮЩИЕ АНТАГОНИСТИЧЕСКИМ ДЕЙСТВИЕМ
- 9.0. Ферменты
- 9.0.1. Конформационная адаптация фермента к субстрату
- 9.0.4. Простые модели ферментов
- 9.0.5. Биологическая регуляция ферментов
- 9.0.6. Ферменты и лекарственные вещества
- Необратимые ингибиторы активного центра ферментов (НИАЦФ)