Циклодекстриногенные бактерии — продуценты ЦГТаз
Большинство из выделенных продуцентов ЦГТаз обитают в почве и принадлежат к широкой группе бактерий порядка Bacillales, объединяющего несколько семейств (Paenibacillaceae, Bacillaceae, Thermoactynomicetaceae и др.), к которым, в свою очередь относятся уже 20 родов (данные на конец 2004 г.).
Изменения в систематике Bacillaceae, произошедшие с середины 1990-х, привели к тому, что большинство ранних представлений о таксономическом положении циклодекстриногенных бактерий, устарело и требуют пересмотра. Сейчас остаются понятными лишь самые общие детали, касающиеся ответа на вопрос о филогенетической модели ареала распространения способности к биосинтезу циклодекстринов в микробном мире.Paenibacillus macerans. Наиболее изучены циклодекстриногенные микроорганизмы, вида Paenibacillus macerans, впервые обнаруженные и описанные Шардингером в 1902-1905 гг. (до 1996 г. носили название Bacillus macerans). Принадлежат к семейству Paenibacillaceae порядка Bacillales. Клетки культуры имеют форму палочек, строение клеточной стенки соответствует грамположительному типу, при выращивании на богатых средах, образуются длинные септиро- ванные нити. При недостатке питания формируют овальные споры, раздувающие спорангий. Положение спор в клетках может быть терминальным, (спорангии напоминают барабанные палочки), субтерминальным и центральным. В условиях анаэробиоза для P.macerans характерна способность к бродильному метаболизму, при этом на средах с глюкозой образуется большое количество газа. Не способны к росту на средах, содержащих более 5% хлорида натрия. После создания соответствующих условий бактерии легко выделяются из почв с использованием накопительных культур на основе альфа-циклодекстрина. Группа Р. macerans фенотипически компактна, и различные штаммы всегда секретируют внеклеточные альфа-ЦГТазы.
Циклодекстриногенная активность является характерной особенностью этого вида.
Наличие внеклеточной ЦГТазы легко обнаруживается по зонам просветления вокруг колоний на средах с крахмалом при последующей обработке проросших чашек Петри в парах металлического йода. Тем не менее, культивирование Paenibacillus macerans в жидкой среде с целью наработки фермента, довольно капризный процесс, не всегда приводящий к обнаружению значительных количеств внеклеточной ЦГТазы. Синтез внеклеточного фермента связан с формированием спор, и нарушение этой функции приводит к исчезновению активности. Типичная среда обитания Paenibacillus macerans — почва,108
Часть II. Примеры применения биотехнологии БАВ в науке и производстве
в ней бактериальные клетки находятся как бы в фиксированном состоянии, размножаются микроколониями, при выраженном недостатке субстрата. Развитие культуры в жидкой среде, в отсутствии физического контакта между клетками, при наличии избытка питательных веществ, зачастую приводит к нарушению процессов естественной споруляции. Проблема может быть решена методами селекции штаммов, с улучшенной способностью к формированию спор на богатых средах. Культуры пассажируют в избытке субстрата, регулярно проводя жесткую термообработку инокулята между пересевами. Вегетативные клетки при температуре выше 70-80"С гибнут и выживают лишь спорулирующие варианты. Для Р. macerans типична секреция альфа-специфичной ЦГТазы. Культивирование в ферментерах осуществляют в периодическом режиме, в аэробных условиях на богатых средах, содержащих крахмал в качестве индуктора фермента, источники аминного азота, а также мел, который предохраняет среду от избыточного закисления.
Bacillus circulans. Описано достаточно большое количество культур циклодекстриногенов, отнесенных к В. circulans, являющихся продуцентами внеклеточной бетаЦГТазы, секреция которой может быть и не связана со спорообразованием (однозначных описаний нет). Известные штаммы В. circulans выращивают в аэробных условиях на жидких питательных средах, содержащих крахмал или муку, а также ростовые добавки.
Режим культивирования периодический, уровень pH поддерживают, в частности, путем добавления в среду мела. Активность фермента хорошо сохраняется во время операции распылительной сушки. В последнее десятилетие было показано, что группа Bacillus circulans, в описаниях сделанных до 1996 г., включала филогенетически весьма удаленные линии. Как результат, в более поздних таксономических редакциях вид был разделен на новые кластеры, фигурирующие сейчас под другими названиями.Алкалофильные бациллы — продуценты ЦГТазы известны с начала 1970-х гг. прошлого столетия. Впервые были выделены японским микробиологом К. Хорикоши, их открытие послужило отправной точкой для организации масштабных технологических процессов бета-циклодекстрина по типу неконтролируемой конверсии. В большинстве случаев алкалофильные бациллы являются носителями генов бета-ЦГТазы. Обсуждаемые разновидности бацилл циклодекстриногенов таксономически весьма гетерогенны и об этом свидетельствует спектр названий, использованных для обозначения штаммов-продуцентов. Описаны и частично охарактеризованы алкалофильные и алкалотолерантные культуры, обозначенные B.circulans var. alkalophilus (р-ЦГТаза, Nakamura, Horikoshi, 1976); В. firmus alkalophilus, (р-ЦГТаза, Do с соавт., 1993); В. firmus/lentus 290-3 (у-ЦГТаза Schmid с соавт., 1988); B.lentus (р-ЦГТаза, Sabione, Park, 1992); B. agaradhaerens LS-3C (Martins c cobt. 2003).
Культивирование алкалофильных и алкалотолерантных бацилл осуществляют в ферментерах, в условиях активной аэрации, при этом используются щелочные питательные среды разнообразного состава (pH = 9 — 10), содержащие в своем составе до 1% карбоната натрия.
Продуценты циклодекстринглюканотрансферазы, развивающиеся при нормальных значениях pH. Среди нормофильных (развивающихся при нормальных pH) бацилл с циклодекстриногенной активностью, могут быть упомянуты лишь единичные культуры, идентифицированные авторами в качестве В. subtilis 313 (у-ЦГТазаКаго, Horikoshi), 1986; В. coagulans YH-1306 (р-ЦГТа- за Horikoshi 1989); В.
ohbensis sp. пои. С-1400 (р-ЦГТаза Sato et al., 1985) В. megaterium FERM P-935 (р-ЦГТаза Shiosaka, 1975), В. amyloliquefaciens AL 35 (а-ЦГТаза Yu et al., 1988); B. autoliticus FERM P-10901 (р-ЦГТаза Tomita et al., 1993). Авторы работ приводят весьма обобщенные сведения по физиолого-биохимической идентификации перечисленных культур, в связи с чем, к некоторым из перечисленных названий следует относиться с достаточно высокой степенью скептичности. С большей степенью уверенности можно говорить лишь о том, что перечисленные штаммы входят в порядок Bacillales.Термотолерантные циклодекстриногены. В попытках выделить продуценты ЦГТаз, обладающих высокой термостабильностью, были изучены культуры, обозначенные авторами в качестве В. stearothermophilus ИНМИА-3849, (а+р-ЦГТаза Абелян В.А., 1991); В. stearothermophilus SE-4 (р-ЦГТаза Edahiro, Yamamoto, 1992); В. stearothermophilus ТС-91 (р-ЦГТаза Sakai et al., 1987); В. stearothermophilus (а+р-ЦГТаза Fujiwara et al., 1990). Культуры развивались при температурах 60 °С на средах относительно небогатого состава, в аэробных условиях и, по данным авторов, секретировали ЦГТазы с термостабильностью Топт = 65-80 °С. Это были как бета-ЦГТазы, так и ферменты со смешанной специфичностю (альфа+бета-ЦГТазы), катализировавшие синтез примерно равных пропорций альфа и бета-циклодекстринов. В 2001 г. представители В. stearothermophilus были отнесены к роду Geobacillus.
К порядку Bacillales (семейство Thermoactinomycetaceae) относятся, по всей видимости, штаммы, выделенные в 1995 г. В.А.Абелян и обозначенные Thermoactinomyces sp. (штаммы ИНМИА-А561
и А554). ЦГТазы перечисленных культур проявляли высокую стабильность в интервале pH 5,5-8,5, а максимальную циклизующую и декстриногенную активность при pH 6,0-7,0 при температурах ниже 55—60 °С. Другой штамм Thermoactinomyces thermosulfurigen.es EMI был выделен Wind с соавторами также в 1995 г.
Продуценты ЦГТаз, не относящиеся к порядку ВасШасеае. Прежде всего, в обозначенную группу следует отнести два штамма Klebsiella (порядок Enterobacteriales семейство Enterobacteriaceae).
Наибольшее распространение получил штамм условно патогенных энтеробактерий Klebsiella pneumoniae M5al, синтезирующих внеклеточную альфа-ЦГТазу. Клетки этих бактерий — малоподвижные палочки со слизистой капсулой имеющих грам-отрицательное строение клеточной стенки. Культура относится к разряду факультативных анаэробов, развивается при температуре 28 °С, на богатых средах с нормальным значением pH = 6,5. В более поздних работах (Schmid, 1989) этот же штамм Klebsiella pneumoniae М5а1 был определен уже как К. oxytoca М5а1. Другая культура ци- клодекстриногенов К. oxsytoca 19-1 была выделена Lee с соавторами (1992). Практического значения продуценты Klebsiella не имеют, вследствие условной патогенности самих микроорганизмов и низкой температурной стабильности фермента (до 40 °С)Среди малоизученных штаммов, с циклодекстриногенной активностью следует назвать отдельные изоляты Micrococcus varians и Micrococcus luteus, выделенные Yagi в 1982 г. Клетки культур были представлены неподвижными сферическими клетками, не образовывашими спор и анаэробно развивавшихся при pH = 6,8 - 8,5 при t = 25 - 37 °С.
Существенный практический и теоретический интерес представляют сообщения об обнаружении единичных циклодекстриногенных культур среди бревибактерий Brevibacterium sp. 9605 (Mori с соавт, 1994), облигатных анаэробов Clostridium thermohydroamylolyticum АТСС 39252, АТСС 53016, (Starnes, 1991). архей-гипертермофилов Thermococcus sp. В001 (Tachibana с соавт. 1999), псевдомонад Pseudomonas species NRRL B-18375 (Allenza, 1990).
9.
Еще по теме Циклодекстриногенные бактерии — продуценты ЦГТаз:
- Подбор бактерий-продуцентов ЦГТазы для процессов получения циклодекстринов
- Выбор продуктивного штамма для процессов получения ЦГТазы
- Продуценты тилозина
- Хранение продуцентов тилозина и проведение поддерживающей селекции штаммов
- Продуценты липидов
- Исследование ростовых свойств продуцентов гомелина, лепидоцида и битоксибациллина
- Хранение культуры продуцента и подготовка его к работе
- Биосинтез аргинина мутантными штаммами-продуцентами Brevibacterium flavum
- Штаммы-продуценты аргинина и методы их получения
- Приготовление и хранение посевного материала продуцентов тилозина
- Физико-химические и биологические свойства культуральной жидкости. Исследование физиологии продуцента дендробациллина
- Основные физиолого-биохимические свойства штаммов-продуцентов рибофлавина
- Хранение исходных штаммов продуцентов
- Условия культивирования продуцентов тилозина
- Позитивное окрашивание бактерий
- Длительность жизни бактерий на мухах и в их различныхо р г а н а х
- Определение формы и размеров бактерий
- Микроводоросли как первые продуценты дейтерированных соединений
- Влияние условий культивирования продуцентов на биосинтез аргинина
- 2.1, Стресс у бактерий и реакция на него