2.5.5 Отбор клонов, несущих рекомбинантные плазмиды
Обычно для отбора целевых рекомбинантных клонов после трансформации либо применяют рестрикционный анализ плазмидной ДНК, либо проводят скрининг бактериальных колоний методом ПЦР.
Для скрининга используют пару встречных праймеров, отжигающихся на сайты, расположенные в векторе по разные стороны от полилинкера (структура праймеров для плазмиды pQE-30 приводится в практической части). Проводится амплификация ДНК из случайно выбранных 10-20 колоний, и по длине полученного фрагмента ДНК судят о наличии или отсутствии вставки.Однако, как уже говорилось, в случае работы с генами флуоресцентных белков, рекомбинантные колонии можно легко отобрать по их фенотипическому проявлению - флуоресценции, которую можно детектировать с помощью любого флуоресцентного микроскопа или бинокуляра. Можно также использовать УФ-лампу, однако надо иметь в виду, что облученные УФ бактерии в основном гибнут, что затруднит дальнейшую работу по наращиванию биомассы.
В случае отсутствия флуоресценции чашку следует оставить на +4°С в холодильнике на 1-2 сут. для того, чтобы дать флуоресцентному белку «созреть» (сформировать правильную трехмерную структуру), после чего повторно проанализировать колонии на наличие флуоресценции. Успешным результатом задачи является получение флуоресцирующих бактериальных колоний.
2.6.
Еще по теме 2.5.5 Отбор клонов, несущих рекомбинантные плазмиды:
- Отбор клонов
- Задача 4. Амплификация, клонирование и экспрессия гена флуоресцентного белка Clavularia, отбор целевых клонов
- 2.9.1. Устройства отбора проб донных отложений и пробоотборные системы для отбора проб воды.
- Профессионально-психологический отбор как элемент профессионального отбора
- Выделение рекомбинантнного белка из биомассы
- Очистка рекомбинантного белка (задача 5)
- Применение аллергена туберкулезного рекомбинантного для выявления и диагностики туберкулеза у детей с ВИЧ-инфекцией
- I. Рекомбинантный активировнный белок C (Recombinant activated protein C - rhAPC)
- 2 Отбор проб молока
- Отбор проб для исследования
- Структура системы профессионально-психологического отбора
- 1 Отбор проб и составление среднего образца
- 2 Отбор и доставка проб молока (секрета)
- 2.2. Средства отбора проб
- 12. Принципы профессионального отбора, этапы