Использование многомерного разведочного анализа для определения прогностической значимости клинико-морфологических факторов и полиморфизмов гена TYMS

Определение дополнительных факторов прогноза при местнораспространенном раке желудка является крайне актуальной задачей в настоящее время. С этой целью в различных отраслях медицины и биологии активно исследуются многочисленные изменения, происходящие с клеткой в процессе ее злокачественной трансформации.

маркеры имеют высокую прогностическую ценность. Для определения прогностической значимости исследуемых нами клинико-морфологических факторов и полиморфизмов гена TYMS был проведен многомерный разведочный анализ (анализ соответствий). Подобный анализ позволяет судить о взаимосвязи тестируемых клинических и молекулярных признаков. Объединение точек, соответствующих клиническим и молекулярным параметрам, в одной группе указывает на наличие тесной связи между ними и влияние на прогноз заболевания.

Многомерный разведочный анализ проведен для 58 больных, которым проводилась адъювантная химиотерапия после радикальной операции. При внимательном рассмотрении представленных ниже графиков можно выделить области, в которых группируются точки, отражающие генотипы и клинические признаки.

На рисунке 27 при изучении взаимосвязи между клиникоморфологическими свойствами опухоли и полиморфизмами гена TYMS 3'UTR видно объединение точек в две большие группы.

Рисунок 27. Взаимосвязь между полиморфизмами гена TYMS 3'UTR и клинико-морфологическими характеристиками опухоли.

Первая группа точек объединяет признаки, характеризующие более агрессивный характер роста опухоли: наличие метастатического поражения лимфоузлов, диффузный тип по классификации Р.Lauren, наличие рецидива заболевания в течение первых 3 х лет после операции на фоне проведения химиотерапии. В эту же группу точек попал признак, определяющий локализацию первичной опухоли в теле желудка, что косвенно может свидетельствовать о том, что данная локализация опухоли связана с худшим прогнозом.

Полученные при анализе соответствий результаты согласуются с приведенными выше данными статистического анализа посредством дисперсионного анализа Краскела-Уоллиса и подтверждают прогностическую значимость генотипа А-6/А-6 в качестве фактора благоприятного прогноза при местно-распространенном раке желудка . Взаимосвязь между генотипами А/А и А/-6 и клинико-морфологическими признаками, отвечающими за благоприятный прогноз у больных местно-распространенным раком желудка, не подтверждается статистическим анализом данных при помощи двустороннего точного критерия Фишера и дисперсионного анализа Краскела - Уоллиса. Тем не менее, многомерный разведочный анализ данных является самостоятельным методом анализа для определения взаимосвязи клинических и молекулярных факторов, значимых для прогноза заболевания.

На рисунке 28 при изучении взаимосвязи между полиморфизмами 5'UTR VNTR и клинико-морфологическими свойствами опухоли наблюдается объединение точек в три области.

Рисунок 28. Взаимосвязь между полиморфизмами гена TYMS 5'UTR VNTR и клинико-морфологическими характеристиками опухоли.

Первая область объединяет только клинические признаки опухоли, связанные с благоприятным прогнозом (отсутствие рецидива заболевания) такие как интестинальный тип рака желудка по классификации Р.Lauren, возраст больных старше 60 лет.

комбинированного лечения частота встречаемости генотипа 3R/2R имела тенденцию к достижению достоверности (р=0,078).

На следующем рисунке 29 отображена ассоциация между сочетанными полиморфизмами и клинико-морфологическими свойствами опухоли, и выделяется две области ассоциированных между собой признаков.

Рисунок 29. Взаимосвязь между полиморфизмами гена TYMS 5'UTR VNTR + SNP и клинико-морфологическими харак~^нерис~^чикам,и опухоли.

Первая область объединяет признаки, связанные с отсутствием рецидива: интестинальный тип по Р^шє^ отсутствие метастазов в лимфоузлы, возраст больных >60лет, локализация опухоли в антральном отделе, отсутствие рецидива в течение 3 лет после операции, а также генотипы 2G/3C и 2G/3G. Вторая область связана с развитием рецидива рака желудка: диффузный тип, метастатическое поражение лимфоузлов, локализация в теле, возраст больных моложе 50 лет и генотип 3С/3С. Взаимосвязь между генотипом 2G/3C и отсутствием рецидива у больных местно-распространенным раком желудка на фоне комбинированного лечения подтверждают приведенные выше данные статистического анализа посредством критерия Фишера (р=0,023), что говорит о прогностической значимости данного генотипа в качестве фактора эффективности проводимого лечения.

Также в ходе многомерного разведочного анализа, мы определили наличие ассоциации некоторых полиморфизмов с такими характеристиками опухоли, как размер и степень дифференцировки опухоли.

На рисунке 30 видно, что имеется 4 области ассоциации клинических и молекулярно-генетических факторов.

Рисунок 30. Взаимосвязь между полиморфизмами гена TYMS, размером опухоли и морфологическим типом опухоли

Первая группа включает в себя неблагоприятные характеристики опухоли: перстневидно-клеточный рак (ПКР), низкодифференцированная аденокарцинома (G3), размер опухоли >4 см и полиморфизмы A/A и 3G/3G. Вторая группа включает размер опухоли 2-4 см, умеренно

дифференцированную аденокарциному (G2) и полиморфизм A/A-6. Третья группа включает размер опухоли