3.7 Протеомное профилирование возбудителей инвазивного кандидоза

В связи с установленной тенденцией к увеличению встречаемости комплекса видов C. parapsilosis среди C. не-albicans видов, нами был изучен состав

этого комплекса с помощью MALDI-TOF масс-спектрометрии (рисунок 33).

Рисунок 33 – Дендрограмма белковых масс-спектров штаммов C. parapsilosis

(n=65). №№ 1–5 –номера субкластеров

Проведенным иерархическим кластерным анализом основных масс- спектропрофилей комплекса C. parapsilosis выявлено, что все исследуемые штаммы комплекса принадлежали только к виду C. parapsilosis. Изолятов C.

orthopsilosis, C. metapsilosis в России не обнаружено. Все полученные масс- спектры были распределены по 5 субкластерам сообразно их родству между собой. Дальнейшее, более подробное, деление также происходило по принципу родства. Были обнаружены близкородственные масс-спектры у некоторых изолятов, которые были выделены в одних и тех же городах, в одних и тех же стационарах, в один промежуток времени, но от разных пациентов (изоляты №№ 29, 30, 31 – г. Москва , №№ 14, 15 – г. Тюмень, №№

24, 42 – г. Санкт-Петербург). Также выявлено, что изоляты №№ 21 и 39,

устойчивые к флуконазолу, располагались в субкластере № 2, а изоляты №№

24 и 41 находились в субкластере №3 и обладали устойчивостью и к вориконазолу (изолят №41).

а б

в г

Рисунок 34 – Масс-спектро профили редких возбудителей ИК: а – С. utilis, б -

C. lusitaniae, в – C. kefyr, г – C. bracarensis.

При сравнении масс-спектров C. parapsilosis, выделенных в России с масс-спектрами тест-штаммов из зарубежных коллекций микроорганизмов, приведенныхв базе данных Bruker Biotyper обнаружили различие белковых масс-спектропрофилей C. parapsilosis исследуемых штаммов от зарубежных коллекций типовых культур (рисунок 35). Также установлено, что масс- спектр штамма C. bracarensis, выделенный в России отличается от масс- спектров штаммов находящимся в Центральном бюро грибных культур в Нидерландах (рисунок 36). При сравнении масс-спектро-профилей штамма C. utilis, выделенного в РФ, со штаммами из зарубежных коллекций наоборот выявлено близкое сходство между ними (рисунок 37).

Таким образом, протеомные профили редких видов Candida spp. различны, что диктует необходимость дальнейшего наблюдения за видовым спектром, циркулирующим на территории России.