Анализ ассоциаций 48 полиморфных вариантов 6 генов-кандидатов системы нейротрофического фактора (NTRK2, BDNF, NGF, NTRK3), нейрексофилина 1 (NXPH1) и нейрексина 1 (NRXN1) и их гаплотипов с риском развития параноидной шизофрении
Особый интерес при изучении предрасположенности к параноидной шизофрении представляют гены системы нейротрофического фактора: NGF (1p13.1) - фактор роста нервов, BDNF (11p13) - нейротрофический фактор головного мозга, NTRK2 (9q22.1) - тирозинкиназный рецептор TrkB, NTRK3 (15q25) - тирозинкиназный рецептор TrkC, а также гены нейрексофилина 1 NXPHl (7p22) и ген нейрексина 1 NRXNl (2p16.3), поскольку недавно была показана их вовлеченность в формирование предрасположенности к различным аффективным расстройствам (Otnaess et al., 2009; Athanasiu et al., 2011).
Нами была проведена оценка неравновесия по сцеплению между 48 полиморфными локусами в генах NGF, BDNF, NTRK2, NTRK3, NXPHl, NRXNl. Локусы, показавшие неравновесие по сцеплению, были объединены в гаплотипические блоки. При проведении гаплотипического анализа полиморфных локусов гена нейротрофического фактора головного мозга BDNF был сконструирован гаплотипи- ческий блок, состоящий из полиморфных локусов rs2203877, rs7l24442, rs6265, rsl0767665, rsl49l850 (рис. 5).
Рис. 5. Неравновесие по сцеплению (D') между полиморфными локусами rs2203877, rs7l24442, rs6265, rsl0767665, rsl49l850 гена BDNF. а) у русских; б) у татар
Частота гаплотипа BDNF*T*C*G*G*T была достоверно ниже как в общей выборке больных (русских и татар) (х2=10,472; Р=0,0012; OR=0,39), так и у больных русской (х2=4,456; Р=0,0348; OR=0,37) и татарской (х2=4,235; Р=0,039; OR=0,43) этнической принадлежности по сравнению с таковой у здоровых индивидов. Сравнительный анализ распределения частот генотипов и аллелей показал, что аллель BDNF*C полиморфного локуса rs2203877 встречался достоверно чаще в общей выборке больных по сравнению с таковой у здоровых индивидов (х2=4,456; Р=0,0348; OR=0,37).
Изучение шести полиморфных вариантов гена тирозинкиназного рецептора TrkB (NTRK2) показало, что аллель NTRK2*C полиморфного локуса rs1443445 является маркером риска развития ПШ у русских (х2=5,093; Р=0,024; OR=1,77).
Исследование распределения частот аллелей и генотипов полиморфных локусов гена тирозинкиназного рецептора TrkB (NTRK3) выявило маркеры риска развития ПШ: по полиморфному локусу rs1946698 - аллель NTRK3*G у русских и татар (Х2=12,316, Р=0,0004, OR=1,77); у русских (х2=17,164; Р=0,000034; OR=2,62); по полиморфному локусу rs7170062 - аллель NTRK3*T у русских и татар (х2=13,437; Р=0,0002; OR=1,77); у русских (х2=17,208; Р=0,000033; OR=2,59); по полиморфному локусу rs 11631508 - аллель NTRK3*A у русских и татар (х2=9,439; Р=0,0021; OR=1,83); у русских (х2=8,485; Р=0,0036; OR=2,18).При проведении анализа гаплотипов гена тирозинкиназного рецептора TrkC (NTRK3) был сконструировано два гаплотипических блока (рис. 6): блок 1 - rs 1435402, rs 1946698, rs 7170062, rs 11631508, rs 12594283, блок 2 - rs 3825884, rs 1110306, rs 11073767, rs 11629691, rs 7176520. Гаплотип NTRK3*T*G*T*A*A* гап- лотипического блока 1 встречался достоверно чаще как в общей выборке больных ПШ (русских и татар) (х2=8,938; Р=0,0028; OR=1,66), так и у больных русской этнической принадлежности (х2=10,471; Р=0,00012; OR=2,25). Полногеномный анализ сцепления показал, что хромосомный регион 15q25,3-q26,2, в котором находится ген NTRK3, сцеплен с шизофренией и депрессивными расстройствами (Feng et al.,
Рис. 6. Неравновесие по сцеплению (D') между полиморфными локусами rs1435402, rs1946698, rs7170062, rs11631508, rs12594283 гена NTRK3 у русских
2006; Need et al., 2009). Полученные нами данные подтверждают вовлеченность гена NTRK3 в формирование предрасположенности к ПШ.
Исследование распределения частот аллелей и генотипов полиморфных локусов гена нейроксофилина 1 (NXPH1) показало, что аллель NXPH1*A полиморфного локуса rs886505 является маркером риска развития ПШ у русских и татар (х22=4,419; Р=0,0356; OR=1,52), а аллель NXPH1*G полиморфного локуса rs 7801099 является маркером риска развития данного заболевания у русских (%2=9,149; Р=0,0025; OR=2,26) (рис.7).
Рис. 7. Маркеры повышенного и пониженного риска развития параноидной шизофрении у русских
В результате проведенного анализа распределения частот аллелей и генотипов полиморфных локусов гена нейрексина 1 (NRXN1) было обнаружено, что частота аллеля NRXN1*A полиморфного локуса rs1469794 в общей выборке больных (русских и татар) была достоверно выше таковой у здоровых индивидов (х2=11,277; Р=0,0008; OR=2,11), также данный аллель NRXN1*A является маркером риска развития ПШ у татар (х2=10,372; Р=0,0013; OR=2,75) (см. рис. 7).
Генетические маркеры риска развития параноидной шизофрении по трем изученным полиморфным локусам гена фактора роста нервов NGF не выявлены.
Развитие такого мультифакториального заболевания, как шизофрения, опосредовано аддитивными и эпистатическими взаимодействиями генетических факторов и модулирующим влиянием средовых факторов (Ebstein, 2006). Поскольку ранее было постулировано, что вклад каждого генетического маркера в развитие предрасположенности к психическим расстройствам составляет менее 1%, а роль наследственности в формировании этого психического расстройства достигает 40-70% (Owen, 2012), для выявления роли генетического компонента в развитии шизофрении необходимо совместное исследование более 50 кандидатных генов с учетом факторов окружающей среды.
В результате анализа межгенных взаимодействий 48 полиморфных локусов 6 генов нейротрофической системы мозга в детерминации риска развития ПШ в этнических группах русских и татар из РБ были установлены две модели межгенных взаимодействий: 1) NRXNl (rs2678228)* NXPHl (rs6952939) у русских и татар (Х2=11,39; Р=0,000074; OR=2,093); 2) NXPHl (rs10272916)* NTRK3 (rs11631508) у татар (х2=10,81; Р=0,001; OR=5,574).
Таким образом, исследование полиморфных вариантов генов-кандидатов параноидной шизофрении в популяциях русских и татар в Республике Башкортостан выявило выраженные межэтнические различия изучаемых групп по распределению частот аллелей и генотипов полиморфных локусов генов PRSS16, ZNF804A, G72, SLC18A1, APBA2, CHRNA7, DISC1, NRG1, RELN, PLXNA2, RGS2, GRIN2B, NTRK2, BDNF, NGF, NTRK3, NXPH1, NRXN1 и генетическим факторам риска развития данного заболевания.
Установлено, что генетическими маркерами 1) повышенного риска развития ПШ являются: а) у русских и у татар: генотип PRSS16*T/*T, аллель PRSS16*T полиморфного локуса rs13219354 гена PRSS16; генотип SLC18A1*A/*A и аллель SLC18A1*A полиморфного локуса rs2270641 гена SLC18A1; аллель BDNF*C полиморфного локуса rs2203877; аллель NTRK3*G полиморфного локуса rs1946698 гена NTRK3; аллель NTRK3*T полиморфного локуса rs7170062 гена NTRK3; аллель NTRK3*A полиморфного локуса rs11631508 гена NTRK3; аллель NRXN1*A полиморфного локуса rs1469794 гена NRXN1; аллель NXPH1*A полиморфного локуса rs886505 гена NXPH1; гаплотип BDNF*T*C*G*G*T (rs 2203877, rs 7124442, rs 6265, rs 10767665, rs 1491850); б) у русских: аллель G72*C полиморфного локуса rs3918342 гена G72 (DAOA); генотип ZNF804A*A/*A полиморфного локуса rs1344706гена ZNF804A; гаплотипы GRIN2B*T*A *T*Cи GRIN2B^^*T*C по полиморфным локусам rsl805502, rsl805476, rsl805247, rsl805482 и rs1805482 гена GRIN2B. аллель NTRK2*С полиморфного локуса rs1443445 гена NTRK2; аллель NXPH1*G полиморфного локуса rs7801099 гена NXPH1; в) у татар: генотип GRIN2B*T*/*T и аллель GRN2B*T полиморфного локуса rs1805247 гена GRIN2B. 2) пониженного риска развития ПШ являются: а) у русских и татар: аллель PRSS16*C полиморфного локуса rs13219354 гена PRSS16; б) у татар: гаплотип GRIN2B*С*С*С*C по полиморфным локусам rsl805502, rsl805476, rsl805247, rsl805482 и rs1805482 гена GRIN2B. 3) эффективности типичных нейролептиков (ТН) в отношении позитивной симптоматики (ПС): генотип RGS2*C/*C по полиморфному локусу rs2746072 гена RGS2 у русских; PLXNA1*G/*G у русских и татар; в отношении негативной симптоматики (НС): RGS2*C/*C (rs4606) у татар. 4) низкой эффективности терапии шизофрении ТН в отношении психопатологической симптоматики: SLC18A*A/*A (rs2270641) у русских; RGS2*A/*A (rs2746071); GRIN2B*^*C (rs1805502) у татар; в отношении НС: GRN2B*0/*C (rs1805502) у татар. 5) повышенного риска развития экстрапирамидного синдрома (ЭПС) у больных ПШ при приеме ТН являются генотипы: RGS2*T/*T rs2746073, RGS2*C/*C (rs4606), RGS2*A/*A (rs274607l) у русских. 6) генетическим маркером пониженного риска развития ЭПС является генотип APBA2*T/*T (rs8040932) у татар.Результаты настоящего исследования раскрывают некоторые патогенетические аспекты шизофрении и вносят вклад в общее представление о молекулярногенетических основах развития данного заболевания, что в будущем будет иметь огромное значение для ранней диагностики шизофрении и разработки новых лекарственных средств для ее лечения. Выявленные результаты не претендуют на исчерпывающую характеристику молекулярно-генетических основ параноидной шизофрении, но являются важным шагом на пути понимания механизмов формирования данного психического расстройства.
4.
Еще по теме Анализ ассоциаций 48 полиморфных вариантов 6 генов-кандидатов системы нейротрофического фактора (NTRK2, BDNF, NGF, NTRK3), нейрексофилина 1 (NXPH1) и нейрексина 1 (NRXN1) и их гаплотипов с риском развития параноидной шизофрении:
- Анализ ассоциации полиморфных вариантов генов-кандидатов с параноидной шизофренией и ответом на типичные нейролептики
- Анализ ассоциации полиморфных вариантов генов, ассоциированных с шизофренией, по данным полногеномных исследований, с риском развития параноидной шизофрении и ответом на нейролептики в популяциях русских и татар из Республики Башкортостан
- Анализ взаимосвязи полиморфных вариантов генов TYMS и ТР53 с клинико-морфологическими характеристиками опухоли и с рецидивированием рака желудка
- Анализ полиморфных вариантов генов 2 фазы биотрансформаиии ксенобиотиков (GSTMI, GSTTl, GSTPI, NAT2)
- 3.4.2. Анализ ассоциаций исследованных генов с количественными признаками туберкулеза
- 1.1. Анализ полиморфных вариантов і снов 1 фазы бнозрансформацин ксенобиотиков (CYPIAI, CYP2I)6, CYP2EE ЕРІ!XI)
- 3.4.1. Анализ ассоциаций исследованных генов с качественными признаками туберкулеза
- НЕЙРОТРОФИЧЕСКИЙ ФАКТОР МОЗГА (BDNF)
- ФАКТОР РОСТА НЕРВОВ (NGF)
- 1.3 Клинические варианты и факторы риска развития криптококкоза
- • Роль нейротрофических факторов, микроглии и цитокинов
- 2.2.2. Молекулярно – генетические методы анализа полиморфизма генов
- Развитие медицинских ассоциаций по лечению боли
- 6. Искаженное развитие понятийного мышления при детской шизофрении (Л. Щербина).
- Патогенез и факторы, ассоциированные с высоким риском преэклампсии