<<
>>

Анализ ассоциации полиморфных вариантов генов, ассоциированных с шизофренией, по данным полногеномных исследований, с риском развития параноидной шизофрении и ответом на нейролептики в популяциях русских и татар из Республики Башкортостан

Нами были исследованы 69 полиморфных локусов генов PRSS16, ZNF804A, G72, SLC18A1, APBA2, CHRNA7, DISCI, NRG1, RELN, PLXNA2, RGS2, GRIN2B.

Исследования Х. Стефансона с соавторами выявили ассоциацию и сцепление 19 геномных локусов с психическими расстройствами в хромосомном регионе 6p21.3 главного комплекса гистосовместимости (MHC1), где идентифицировано 10 генов (Van Winkel et al., 2010).

Ген PRSS16 (6p21.3—22.1) кодирует протеиназу серина и экспрессируется исключительно в вилочковой железе и локализуется на 6 хромосоме в области главного комплекса гистосовместимости 1 (MHC1).

В результате сравнительного анализа распределения частот генотипов и аллелей полиморфного локуса rs13219354 гена PRSS16 между группами больных и здоровых нами была обнаружена ассоциация гомозиготного генотипа PRSS16*T/*T с риском развития ПШ у русских (%2=14,52; Р=0,0001; OR=1,69; 95%CI 1,28-2,26) и у татар (х2=5,55; Р=0,02; OR=1,35; 95%CI 1,06-1,71). Также было показано, что аллель PRSS16*T является аллелем риска развития шизофрении у татар (%2=4,73; Р=0,03; OR=1,26; 95%CI 1,02-1,56) и у русских (х2=15,32; Р0,59) (рис. 1).

В результате проведенного гаплотипического анализа в группе русских и татар было определено 7 гаплотипов. Было обнаружено, что гаплотип RGS2*A*G*T*C*T достоверно чаще встречался в группе здоровых русских (х2=22,08, Р=0,000003; OR=0,38, 95%CI 0,26-0,57) и татар (х2=24,39; Р=0,000; OR=0,44; 95%CI 0,320,61), чем у больных ПШ. Напротив, частота гаплотипа RGS2*G*G*T*C*T была достоверно выше у больных параноидной шизофренией, чем у здоровых русских (х2=45,77; Р=0,000; OR=21,47; 95%CI 6,59-69,95) и татар (х2=53,51; Р=0,000; OR=18,72; 95%CI 6,69-52,31). Частоты остальных гаплотипов были схожи у больных ПШ и здоровых индивидов русских и татар.

С целью изучения влияния полиморфных локусов rs2746071, rs2746072, rs2746073, rs4606, rs3767488 гена RGS2 на эффективность типичных нейролепти-

Рис.

1. Неравновесие по сцеплению (D') между полиморфными локусами rs2746071, rs2746072, rs2746073, rs4606, rs3767488) гена RGS2. а) у русских; б) у татар

ков у больных с ПЭШ русских и татар из РБ был проведен однофакторный дисперсионный анализ, показавший различия в средних значениях по подшкале позитивной симптоматики POSIT на 21-й оценочный день у носителей разных генотипов по полиморфному локусу rs2746072 гена RGS2 у русских (F=3,75; P=0,03). При введении поправки на множественные сравнения Бонферрони были выявлены понижения средних значений у больных, несущих генотип RGS2*C/*C, по сравнению с таковыми, несущими генотип RGS2*G/*G (P=0,027).

Однофакторный дисперсионный анализ, проведенный для выявления степени риска развития ЭПС в группах русских и татар, показал различия в средних значениях по шкале SAS на 21-й оценочный день у носителей разных генотипов по полиморфному локусу rs2746073 (F=3,08; P=0,03), rs4606 (F=4,52; P=0,01), rs2746071 (F=3,87; P=0,03) гена RGS2 у русских и позволил установить генетические маркеры повышенного риска развития экстрапирамидного синдрома (ЭПС) у больных ПЭШ при приеме ТН: RGS2*T/*T rs2746073 (P=0,04), RGS2*C/*C rs4606 (P=0,01), RGS2*A/*A rs2746071 (P=0,024) у русских (рис. 2).

Анализ вариаций ANOVA на 21-й оценочный день у татар показал статистически значимые различия в средних значениях по подшкале негативной симптоматики NEGAT (F=2,93; P=0,03) по полиморфному локусу rs4606 гена RGS2 (F=3,35; P=0,03) за счет понижения средних значений у больных, несущих генотип RGS2*C/*C по сравнению с таковыми, несущими генотип RGS2*G/*G (P=0,018) и PSYCH по полиморфному локусу rs2746071 гена RGS2 (F=3,64; P=0,03) за счет повышения средних значений у больных, несущих генотип RGS2*A/*A, по сравнению с таковыми, несущими генотип RGS2*G/*G (P=0,015).

С целью выявления фармакогенетических маркеров достаточного терапевтического ответа и маркеров риска развития экстрапирамидного синдрома ЭПС был

Рис.

2. Генетические маркеры повышенного риска развития экстрапирамидного симптома у русских по полиморфным локусам rs4606; rs2746073, rs2746071 гена RGS2

проведен сравнительный анализ распределения частот генотипов и аллелей гена RGS2 между группой больных Респондеров и Нереспондеров, а также больных с ЭПС и без ЭПС, однако различия оказались статистически не достоверны. Сравнительный анализ распределения частот генотипов и аллелей гена RGS2 между группой Респондеров и Нереспондеров русских и татар также не показал статистически значимых различий. Анализ неравновесия по сцеплению между пятью маркерами в гене RGS2 выявил наличие неравновесия по сцеплению (D'>0,67) у татар Респондеров и Нереспондеров (рис. 3).

Рис. 3. Неравновесие по сцеплению между пятью маркерами в гене RGS2 выявило наличие неравновесия по сцеплению (D'>0,67) у татар Респондеров и Нереспондеров

В результате проведенного гаплотипического анализа был сконструирован 1 гаплотипический блок на основе пяти полиморфных локусов гена RGS2 у татар Респондеров и Нереспондеров, состоящий из 7 гаплотипов. Было обнаружено, что гаплотип RGS2*G*G*T*C*C (х2=11,02, Р=0,001; OR=0,07, 95%CI 0,01-0,36) достоверно чаще встречался в группе татар Респондеров, чем в группе Нереспондеров. Частоты остальных гаплотипов были схожи у Респондеров и Нереспондеров.

Гипоглутаматергическая гипотеза является одной из нейрохимических гипотез патогенеза шизофрении, постулирующая нарушение глутаматного нейромедиаторного пути, привлекающая внимание исследователей в последнее время, о чем свидетельствуют низкие уровни рецепторов глутамата при посмертном анализе мозга больных и способность средств, блокирующих глутаматную активность, таких как фенциклидин и кетамин, вызывать шизофреноподобные симптомы и когнитивные нарушения (Carlsson et al., 2004; Coyle, 2006; Javitt, 2010; Ohtsuki et al., 2001).

В связи с изложенным выше, изучение ассоциации полиморфных вариантов гена GR1N2B с параноидной шизофренией (ПШ) и с ответом на терапию нейролептиками представляет огромный интерес для исследователей.

Нами была изучена ассоциация шести полиморфных локусов rs1805502, rs1805476, rs1805247, rs1805482, rs7301328, rs34315573 гена GR1N2B с риском развития шизофрении у русских и татар. В результате проведенного анализа было выявлено, что частота генотипа GR1N2B*T/*T(rs1805247) была достоверно выше у больных татарской этнической принадлежности, чем у здоровых (х2=8,40; Р=0,004; OR= 2,32; 95% CI 1,34-4,05). Кроме того, было показано статистически значимое повышение частоты аллеля GR1N2B*T (rs1805247) у больных татарской (х2=10,86; Р=0,001; OR=2,38, 95%CI 1,43-3,92) и русской этнической принадлежности (х2=4,82; Р=0,03; OR=2,03, 95%CI 1,11-3,69). Проведенный анализ ассоциаций не выявил статистически значимых различий в распределении частот генотипов и аллелей по полиморфным локусам rs1805502, rs1805482, rs1805476, rs7301328, rs34315573 гена GR1N2B между больными и здоровыми индивидами русской и татарской этнической принадлежности из РБ.

При проведении гаплотипического анализа полиморфных локусов гена GR1N2B было сконструировано два гаплотипических блока: блок 1 - rs1805502, rs1805476, rs1805247, rs1805482; блок 2 - rs7301328, rs34315573 (рис. 4). При оценке частот гаплотипов гена GR1N2B сильное неравновесие по сцеплению между маркерами rs1805502 и rs1805476 (D’>0,90), и между rs7301328 и rs34315573 (D'~1) было получено как в группе больных и здоровых русских, так и в таковой у татар. На рисунке 4 представлены показатели неравновесия по сцеплению (D’) между маркерами

Анализ распределения частот гаплотипов показал, что в этнической группе русских больных частоты гаплотипов первого блока GR1N2B*T*A*T*C (х2=5,53; Р=0,02; OR=1,63; 95%CI 1,10-2,42) и GR1N2B *C*C*T*C (х2=3,9; Р=0,05; OR=2,29; 95% CI 1,06-4,94) были достоверно выше таковых в группе контроля.

Напротив, гаплотип первого блока GR1N2B *t*C*T*T достоверно чаще встречался у здоровых русских, чем у больных (х2=3,88; Р=0,05; OR=0,58; 95%CI 0,36-0,97). В этнической группе татар был обнаружен протективный маркер - гаплотип первого блока GR1N2B*C*C*C*C (х2=3,79; Р=0,05; OR=0,55; 95%CI 0,31-0,97).

Рис. 4. Неравновесие по сцеплению (D') между полиморфными локусами rs1805502, rs1805476, rs1805247, rs1805482, rs7301328, rs34315573 гена GRIN2B. а) у русских; б) татар

Проведенный однофакторный дисперсионный анализ в выборке больных русской этнической принадлежности выявил статистически значимые различия в средних значениях по шкале SAS на 21-й оценочный день SAS 21 (F=3,76; P=0,03) между носителями разных генотипов полиморфного локуса rs18005502 гена GRIN2B. При введении поправки на множественные сравнения Бонферрони было выявлено повышение средних значений у больных, несущих генотип GRIN2B*C/*C, по сравнению с таковыми, несущими генотипы GRIN2B*C/*Tи GRIN2B*T/*T, однако различия оказались статистически не достоверны (P>0,05).

Анализ вариаций ANOVA выявил достоверно значимые различия в баллах по шкале PANSS у татар (F=5,049; P=0,008) на 21-й оценочный день за счет повышения средних значений по шкале PANSS21 у носителей генотипа GRIN2B*C/*C по сравнению с носителями генотипов GRIN2B*C/*T (P=0,011) и GRIN2B*T/*T (P=0,05); по подшкале общепсихопатологической симптоматики PSYCH21 (F=4,037; P=0,02) на 21-й оценочный день за счет повышения средних значений по PSYCH21 у носителей генотипа GRIN2B*C/*C, по сравнению с таковыми, несущими генотип GRIN2B*C/*T (P=0,011); по подшкале негативной симптоматики NEGAT21 (F=4,626; P=0,011) на 21-й оценочный день за счет повышения средних значений по NEGAT21 у носителей генотипа GRIN2B*C/*C, по сравнению с таковыми, несущими генотип GRIN2B*C/*T (P=0,015).

В результате проведенного сравнительного анализа распределения частот генотипов шести полиморфных локусов - rs1805502, rs1805476, rs1805247, rs1805482, rs7301328, rs34315573 гена GRIN2B между группой Респондеров и Нереспонде- ров русских и татар было выявлено статистически значимое различие (%2=6,82; P=0,033) за счет достоверно более высокой частоты генотипа GRIN2B*T/*T по полиморфному локусу rs34315573 (%2=4,65; P=0,031) у русских Нереспондеров.

Сравнительный анализ распределения частот генотипов по шести полиморфным локусам - rsl805502, rsl805476, rsl805247, rsl805482, rs7301328, rs34315573 гена GRIN2B между группами больных с экстрапирамидным синдромом (ЭПС) и больных без ЭПС у русских и у татар не выявил статистически значимых различий.

3.

<< | >>
Источник: М.В. Угрюмова. НЕЙРОДЕГЕНЕРАТИВНЫЕ ЗАБОЛЕВАНИЯ: от генома до целостного организма. В 2-х томах. Том 2 / Под ред. М.В. Угрюмова. - М.: Научный мир,2014. - 848 с.. 2014

Еще по теме Анализ ассоциации полиморфных вариантов генов, ассоциированных с шизофренией, по данным полногеномных исследований, с риском развития параноидной шизофрении и ответом на нейролептики в популяциях русских и татар из Республики Башкортостан:

  1. Анализ ассоциации полиморфных вариантов генов-кандидатов с параноидной шизофренией и ответом на типичные нейролептики
  2. Анализ ассоциаций 48 полиморфных вариантов 6 генов-кандидатов системы нейротрофического фактора (NTRK2, BDNF, NGF, NTRK3), нейрексофилина 1 (NXPH1) и нейрексина 1 (NRXN1) и их гаплотипов с риском развития параноидной шизофрении
  3. Анализ взаимосвязи полиморфных вариантов генов TYMS и ТР53 с клинико-морфологическими характеристиками опухоли и с рецидивированием рака желудка
  4. Анализ полиморфных вариантов генов 2 фазы биотрансформаиии ксенобиотиков (GSTMI, GSTTl, GSTPI, NAT2)
  5. 6. Искаженное развитие понятийного мышления при детской шизофрении (Л. Щербина).
  6. 3.4.2. Анализ ассоциаций исследованных генов с количественными признаками туберкулеза
  7. Шизофрения
  8. 1.1. Анализ полиморфных вариантов і снов 1 фазы бнозрансформацин ксенобиотиков (CYPIAI, CYP2I)6, CYP2EE ЕРІ!XI)
  9. О природе шизофрении
  10. 3.4.1. Анализ ассоциаций исследованных генов с качественными признаками туберкулеза
  11. Характеристики шизофрении
  12. Шизофрения
  13. 4.1. Эпидемиологическая ситуация по ВИЧ-инфекции в Республике Башкортостан
  14. Молекулярно-генетическое изучение болезни Паркинсона в Республике Башкортостан
  15. Социально-гигиенические аспекты ВИЧ-инфекции среди сельского населения Республики Башкортостан
- Акушерство и гинекология - Анатомия - Андрология - Биология - Болезни уха, горла и носа - Валеология - Ветеринария - Внутренние болезни - Военно-полевая медицина - Восстановительная медицина - Гастроэнтерология и гепатология - Гематология - Геронтология, гериатрия - Гигиена и санэпидконтроль - Дерматология - Диетология - Здравоохранение - Иммунология и аллергология - Интенсивная терапия, анестезиология и реанимация - Инфекционные заболевания - Информационные технологии в медицине - История медицины - Кардиология - Клинические методы диагностики - Кожные и венерические болезни - Комплементарная медицина - Лучевая диагностика, лучевая терапия - Маммология - Медицина катастроф - Медицинская паразитология - Медицинская этика - Медицинские приборы - Медицинское право - Наследственные болезни - Неврология и нейрохирургия - Нефрология - Онкология - Организация системы здравоохранения - Оториноларингология - Офтальмология - Патофизиология - Педиатрия - Приборы медицинского назначения - Психиатрия - Психология - Пульмонология - Стоматология - Судебная медицина - Токсикология - Травматология - Фармакология и фармацевтика - Физиология - Фтизиатрия - Хирургия - Эмбриология и гистология - Эпидемиология -