Получение стабильно меченных БАВ химическими методами
Биологически активные соединения, меченные атомами стабильных изотопов, можно получать путем прямого химического синтеза, с помощью обменных реакций и другими химическими методами, в частности, с применением ферментативного катализа.
Химические синтезы аминокислот, меченных стабильными изотопами, давно известны и широко освещены, например, в классических работах Дауба. В частности, в них продемонстрированы общие синтетические подходы по получению 13С-меченных аминокислот по карбоксильным — СООН- и Соположениям молекул, показана перспективность синтетических подходов. Несмотря на это, очевидно, что химические синтезы сложных соединений часто многостадийны, требуют больших расходов ценных реагентов и меченых субстратов и приводят в результате к продукту, представляющему собой рацемическую смесь D- и L-форм аминокислот. Еще одним недостат ком данного подхода к получению 13С-аминокислот является то, что в таких аминокислотах меченые атомы углерода 13С локализуются, как правило, по карбонильным положениям молекулы. Ксожалению, аналоги с таким положением меченого атома мало пригодны для биологических
исследований вследствие возможной потери стабильной метки 13С за счет функционирования гочисленных реакций ферментативного декарбоксилирования, происходящих в организме. К этого, до настоящего времени практически не существует подходящего метода для введени в боковые позиции молекулы аминокислоты, так, чтобы каждая стадия химического синтез: ла бы разработана детально. Наиболее успешные синтетические методы введения 13С-метки в нокислоты затрагивают, как правило, такие положения в молекулах аминокислот, как метил группа метионина, С2-кольцевое положение в молекуле гистидина, а также атомы углерода карбоксильных группах аспарагиновой и глутаминовой кислот.
Более тонкие синтезы стабильно меченных аминокислот были, как правило, свяа с использованием комбинации химических и ферментативных подходов.
Например, мн< 13С-аминокислоты, включая (2Б,38)-[4-13С]-валин, [3-13С]-триптофан и другие меченые ам; кислоты, были синтезированы с использованием ферментных препаратов. Для этого метода лучения меченых аналогов перспективно и экономически оправдано использование очищен ферментов, клеточных экстрактов, бесклеточных ферментативных систем И, особенно, ИМ1Ф лизованных ферментов. Так, ферментативные реакции осуществляют на иммобилизован; ферментах, например, аланиндегидрогеназы в присутствии NADH при получении дейтероч нина или иммобилизованной на сахарозе трансаминазы при получении, например, дейт( фенилаланина. Вообще ферментативный метод давно используется для препаративного лабе торного и промышленного получения оптически активных аминокислот, благодаря высо; субстратной специфичности ферментов и возможности селективного введения стабильных г топов по определенным положениям молекул аминокислот. Основными аспектами использг. ния ферментативных систем являются каталические реакции асимметрического образова; связи на прохиральных субстратах и ферментативное разделение рацематов аминокислот. 1 касается хроматографического разделения рацематов на прохиральных сорбентах, то оно все недостаточно эффективно и обеспечивает в лучшем случае больше половины меченого проду; в виде одного из оптических изомеров.Ферментативная стадия часто завершает химический синтез меченых аналогов аминокисл причем использование для этих целей интактных клеток или их экстрактов так же эффектив; как использование очищенных препаратов ферментов. Однако, субстратная специфичность ф ментов, их ограниченная доступность, сложность выделения и очистки ограничивают использо; ние ферментативных систем. Например, разработанная сложная энзиматическая система д получения 13М-аланина включает комплексное использование десятка ферментов и имеет выход целевому продукту не более 1 г.
В литературе также описаны способы получения химико-ферментативными методами дейп рий- и ‘3С-аналогов фенилаланина и тирозина, меченных по различным положениям в молекул Синтез 13С-тирозина был осуществлен через р-нитрофенол с использованием карбоксипептида; А.
Этот путь включал 10 стадий и давал суммарный выход L-формы около 9,2 % . 13С-фенилаланг. получили из ацетата при помощи бензилбромида с использованием в качестве источника меть Ва13СО3. 13С-тирозин в свою очередь был получен этим автором путем ферментативного гидрокс; лирования 13С-фенилаланина, катализируемого фенилаланин-гидроксилазой. Согласно схемг изложенной в цитируемых работах, получение [1-13С]-тирозина требовало пять стадий, однак суммарный выход из ацетата был ниже 4 %. [3,5-О2]-тирозин может быть также синтезирован г [2,4,6'-Б3]-фенола с использованием |3-тирозиназы. Как известно, пиридоксальсодержащий фе; мент p-тирозиназа катализирует образование тирозина и ряд других ферментативных реакції; и вместо серина может использовать в качестве субстратов пируват и 15NH4OH. Это очень удобнТабл. 3. Ростовые субстраты, используемые для биотехнологического введения стабильной изотопной метки
в продукты биосинтеза различных классов продуцентов
| Продуценты | Источники тотальной стабильной изотопной метки | ||||
| D | 13С | 15n | 18O | D+'-3C+15N+,8O | |
| Водоросли, автотрофы | Р2О | 13СО2 | 15nh4ci, Na15NO3 | H218O c18o2 | d218o 13CO2 ■5nd4ci |
| Метилотрофы | d2o CDgOD | 13СН3ОН | l5NH4Cl Na15NO3 | h218o CH318OH | d218o 15cd3,8od 13nd4ci |
| Г етеротрофы | D2O, D-биомасса | 13С-сахара 13С-биомасса | 15NH4C1 Na15NO3 15М-биомасса | h218o І8О-биомасса | d2’8o, множественно меченная биомасса |
для контролирования включения изотопа I5N в молекулы аминокислот, поскольку фермент катализирует разложение серина до пирувата и аммиака.
Получение изотопомеров тирозина и фенилаланина, меченных по фенольному кольцу стабильными изотопами D, 13С, 15N, 17О, 18О, было осуществлено за счет использования клеток бактерий Ervinia herbicola, обладающих высокой активностью также p-тирозиназы.
Тирозин, униформно меченный дейтерием по скелету молекулы, получали из дейтеро-фенола при помощи клеток Е. herbicola. Напомним, что содержание p-тирозиназы в клетках Е .herbicola достигает более 10 % от суммарного белка биомассы. Дейтеро-тирозин далее был конвертирован в бензиловый эфир р-толуен-сульфоната тирозина. Затем гидроксильную группу в молекуле тирозина замещали на остаток 1-фенил-5-хлор-тетразола. В свою очередь гидрогенолиз бензилового эфира 1-фенил-5-хлортетразола тирозина в муравьиной кислоте на 10 % Pd/C приводил к образованию меченого дейтеро-фенилалани- на в три стадии. Выход дейтерий меченного фенилаланина составил 76 % от количества потребленного субстрата. Дейтерированный тирозин также может быть получен в ходе обратных реакций, т. е. ферментативным гидроксилированием фенилаланина с использованием фенилаланингидроксилазы.Очень эффективным оказалось получение 151У-Ь-глутамата из (15NH4)2SO4 и а-кетоглутарата с помощью глутаматдегидрогеназы. Метод изотопного обмена Н -* D, реализуемый в ферментативных системах, позволяет получать оптически активные дейтеро-аминокислоты. Так, описан препаративный метод получения Ь-[2-О]-валина, лейцина, изолейцина и фенилаланина за счет модификации соответствующих субстратов в D2O при непосредственном участии клеточного экстракта из Е. coli. При помощи других ферментов, например, аспартатаминотрансферазы из бактерий Е. coli, которая катализирует Н -» D-обмен в D2O у С2-атома в молекуле аспарагиновой кислоты и в фенилаланине, получены дейтерированные аспарагиновая кислота и фенилаланин.
Следует подчеркнуть, что Н -» D обмен водорода на дейтерий у атома С2 функционирует в реакциях аминокислот, катализируемых пиридоксальзависимыми ферментами: триптофансинтетазой из Е. coli, а-глутаматтрансаминазой, серинтрансгидроксиметилазой. Как и для других пиридок- салькатализируемых реакций, увеличение подвижности обмениваемого на дейтерий атома водорода в положении С2 может быть объяснено образованием Шиффова основания аминокислоты с пиридоксальфосфатом.
Изотопный обмен Н -* D обычно применяют для замещения легко обмениваемых на дейтерий ароматических протонов в остатках фенилаланина, тирозина, триптофана и гистидина, входящих в состав молекул белков. Вследствие того, что замещаемые на дейтерий протии в молекулах белков все же прочно связаны с углеродом и трудно обмениваются в мягких условиях, метод несколько ограничен параметрами нестабильности белков в жестких условиях (85 % HC1/H2SO4, 80 - 100°С), необходимых для реакций изотопного обмена. Этот же подход применен при получении частично дейтерированных антибиотиков (см. выше).
Несмотря на довольно хорошую проработанность способов химического изотопного обмена, продолжаются поиски все более эффективных методов получения высокодейтерированных аминокислот. Так, одной из недавних работ авторы установили, что можно повысить Н -» D обмен в С-Н связях аминокислот и коротких пептидов, если помещать их в D2O обязательно с дитиотриэтолом и проводить радиолиз воды в анаэробных условиях. Однако максимальный уровень дейтерирова- ния, достигаемый в таких экспериментах, не превышал 38 % .
В заключение следует отметить, что, несмотря на многочисленность описанных в литературе подходов по получению биологически активных соединений, меченных стабильными изотопами, в настоящее время не существует универсального подхода, который позволял бы получать аминокислоты, меченные D, 13С, 15N и 18О, химико-ферментативным путем за счет включения меченых низкомолекулярных субстратов.
7.
Еще по теме Получение стабильно меченных БАВ химическими методами:
- Биотехнологический способ получения стабильно меченых БАВ
- Применение иных изотопных вариантов, стабильно меченных БАВ
- Получение меченных БАВ и их использование в биологии и медицине
- Использование 18О-меченных БАВ
- Разработка метода синтеза и получения радиоактивно меченных тритием образцов пептида HLDF-6
- Использование в исследованиях множественно изотопно меченных БАВ
- Метилотрофные микроорганизмы как продуценты изотопно меченных БАВ
- 11.3. Получение меченого зонда.
- Химические методы получения накопительных культур
- Технология получения препаратов БАВ из растений, органов и тканей животных
- 3.4. Роль физико-химических изменений в возникновении помутнений при получении игристых вин на иммобилизованных дрожжах