Применение низкомолекулярных индивидуальных дейтерированных БАВ в научных исследованиях
Индивидуальные дейтерированные БАВ применяются в самых разных исследованиях тогда, когда надо определить пути миграции конкретного соединения в организме, оценить время существования его в клетках или тканях, а также для определения продуктов его взаимодействия с другими компонентами окружения.
Дольше других и более широко используются низкомолекулярные дейтеросоединения. Часто в такого рода исследованиях используют серию из нескольких аналогов изотопно меченных БАВ, отличающихся положением меченых атомов или групп. Так, при исследовании влияния этанола на липидный обмена в клетках гепатоцитов использовали два аналога дейтеро-глиперина — [1,1,3,3-D4]- и [2-Б]-глицерин. Анализ распределения дейтериевой метки позволил зафиксировать наличие двух функционально различающихся пулов sn-глицерин-З-фосфата.
В начале эпохи использования дейтерированных БАВ много работ было сделано с использованием дейтеро-сахаров. Наблюдая за включением дейтериевой метки из молекул [2-Б]-глюкозы в те или иные фрагменты co-циклогексил жирных кислот ацидофильных термофильных бактерий, установили, что метка чаще всего встречается во втором положении циклогексильного кольца, т. е. это кольцо синтезируется непосредственно из экзогенной глюкозы. Аналогично, по включению метки в молекулы ш -циклогексил жирных кислот, показана вовлеченность шикимата и цик- логексилкарбоксилата в данную ветвь биосинтеза в качестве интермедиатов. Тот же подход был использован для подтверждения включение ББ-[3,3-Б2]-серина в синтез сфинголипидов клетками скользящих бактерий Cytophaga johnsonae.
Более сложная схема исследования была реализована при изучении фрагментации молекулы противоопухолевого антибиотика стауроспорина. На первом этапе авторы выделяли препараты антибиотика, получившего метку от одного из четырех источников: Б-[6,6-Б2]-глюкоза.
D-[2-D]- глюкоза, Н-[и-Б2]-глюкоза или D2O, на втором — изучали распределение дейтериевой метки во фрагментах стауроспорина.Как уже неоднократно подчеркивалось, не только D2O, но и более сложные дейтеро-соединения можно свободно использовать непосредственно на людях, даже на больных. Именно эта особен ность способствует постепенному вытеснению радиоизотопов и расширению вовлечения стабильно
меченных БАВ в практику медицины. Известно, что нарушения углеводного метаболизма могут приводить к тяжелым заболеваниям человека. Методами высокого разрешения исследовали гликогенолиз и глюконеогенез в клетках печени у представительной выборки здоровых субъектов и больных циррозом печени. Уровень глюконеогенеза вычисляли как разницу в доли синтезированной глюкозы, определенной после введения [6,6-В2]-глюкозы и уровнем гликогенолиза. Измеряли также вклад глюконеогенеза в синтез глюкозы крови путем измерения уровня дейтериевой метки в С5/С2 положениях после получения испытуемыми тяжелой воды (5 мл/кг жидкости, содержащейся в теле субъекта). Авторы сделали важный вывод — больные циррозом печени имели заметно увеличенный уровень глюконеогенеза и сниженный уровень гликогенолиза по сравнению с контрольной группой.
Обратила на себя внимание сравнительно недавняя работа израильских ученых, посвященная долговременному использование фруктозы в питании в качестве единственного сахара. Фруктоза, как известно, в естественных условиях в больших количествах встречается в медах и сладких фруктах, ныне производится в кристаллическом виде и в виде глюкозо-фруктозного сиропа (ГФС). Коммерческое использование фруктозы в обработанной пище существенно повысилось за последние 25 лет. Долговременное использование фруктозы в рационе мышей, как оказалось, приводило к таким же изменениям в структуре коллагена, какие происходят при старении организма. Мыши получали фруктозу в течение года в довольно высоких концентрациях 12,5 г/кг (эта доза соответствует потреблению ребенком 30-40 стаканчиков йогурта в день).
Авторы исследования зафиксировали изменения физических, механических и химических свойств коллагена кожи.Ранее было показано, что фруктоза уменьшает толерантность к глюкозе, изменяет метаболизм инсулина и ускоряет процесс гликозилирования (реакция сахара и белков), который сопровождает нормальный процесс старения, а также имеет место при некоторых осложнениях диабета. В этой серии экспериментов обнаружили, что у крыс, получавших фруктозу, ее содержание в крови, а также холестерина и гликозилированного гемоглобина были значительно повышены. Кроме того, фруктоза увеличивала частоту внутримолекулярных и межмолекулярных сшивок коллагена кожи, что вызывает снижение ее эластичности и мягкости. Другими словами — долговременное использование фруктозы приводит к увяданию кожи. Полученные данные, возможно, подведут черту под «фруктозным бумом» последних лет. Не менее важный вывод состоит в том, что требуется продолжение исследований влияния фруктозы на организм человека, а также более тщательное осмысление вопросов, связанных с безопасностью потребления этого сахара как здоровыми, так и диабетическими индивидуумами.
Использование точечно меченных соединений широко используется для определения участия соответствующих атомов или молекулярных групп в ферментативных реакциях. Так, применение [б-Бргалактозы позволило лучше понять механизм каталитического цикла га- лактозооксидазы. В этом цикле обязательно присутствует стадия, на которой фермент содержит свободный радикал, ассоциированный с атомом Си в активном центре. Фермент катализирует двухэлектронное окисление молекулы спирта до альдегида с соответствующим восстановлением О2 до Н2О2. Исследователи использовали метод быстрого определения кинетики для измерения анаэробного восстановления субстрата галактозооксидазы в сочетании с разработанным ими способом, основанным на применении С6-протонированного и С6-дейтерированного субстратов в Н2О и DZO. Так было показано, что обмениваемые протоны не участвуют в кинетически значимых этапах реакции, и что атом водорода, отрывающийся от молекулы галактозы, не теряется в растворе в ходе каталитической реакции, а, напротив, участвует в узловом моменте последующей реакции с кислородом.
В качестве источника дейтериевой метки могут выступать не только углеводы, но и жирные кислоты. Именно благодаря использованию [2,2-В2]-пальмитиновой кислоты для введения изотопной метки в целые клетки Claisen matruchotti и сравнительному исследованию природных и дейтерированных кориномиколатов, установлен внутриклеточный механизм конденсации пальмитата, не включающий постулированную ранее стадию карбоксилирования. Это открытие позволило предложить схему химического синтеза нескольких родственных ингибиторов реакции конденсации, которые, как показано, обладают сильным действием in vivo на С. matruchotti и при концентрации 1—10 мкг/мл полностью подавляют рост колоний.
Расширяется использование искусственных мембран при изучении функциони рования белков и других клеточных структур. Такие исследования требуют разработки методов возможно более точного воссоздания природного состава мембран. Для исследования механизмов слияния везикул искусственных мембран в качестве метки использовали дейтеро-холин. Конформационные изменения, возникающие при смешивании разных липидов в процессе слияния везикул, регистрируются на D-ЯМР-спектрах как изменения в квадруполярном сплайсинге. Используя количественную модель, удалось оценивать степень слияния между везикулами с противоположными зарядами и добиться 100 % -ного слияния малых униламеллярных везикул, состоящих из положительно заряженных (1,2-диолеоулоксу-3-(диметил-аммонио)пропан : 1-пальмитоил-2-олеоил-зп-глицеро-3- фосфохолин : 1-альмитоил-2-олеоил-ап-глицеро-3-фосфоэтаноламин в соотношении 40 : 40 : 20) с большими униламеллярными везикулами (1-пальмитоил-2-олеоил-8п-глицеро-3-фосфо-холин : холестерин : 1-пальмитоил-2-олеоил-8га-глицеро-3-фосфогли-церин — 60:30: 10). Подобные исследования имеют большое значение, поскольку воспроизведение природного липидного окружения модельных белков крайне важно для исследования их работы в мембранах — везикулах.
В качестве примера использования индивидуальных дейтероаминокислопг можно привести недавнюю работу, посвященную изучению кинетики реакции оксидазы П-аминокислот (ЕС 1.4.3.3) изклеток Trigonopsis variabilis.
Сравнивали взаимодействие фермента с [а-*Н]- и [a-D]- фенилглицином в природной и тяжелой воде. Авторы установили, что присутствие атома дейтерия в молекуле аминокислоты гораздо сильнее снижает активность оксидазы, чем тяжелая вода среды. Восстановительная полуреакция двухфазная: сначала дегидрогенирование субстрата при восстановлении ферментного флавина, затем — конверсия при высвобождении продукта. Изотопный эффект дейтерия аминокислоты на реакцию восстановления флавина оценен как 6, тогда как эффект растворителя — 2,8, т. е. и в данном случае влияние дейтерия D2O слабее, чем влияние дейтерия субстрата реакции. В целом, изотопный эффект выглядит как синергидный при высокой степени согласованности этапов реакций.Еще одна работа по одновременному использованию двойной — дейтериевой и фтор 19Е-метки. В данном случае для мечения белка грамицидина использовали триптофан, содержащий 5 атомов дейтерия в индольном кольце (ранее подобные исследования были проделаны с четырьмя вариантами дейтеро-триптофана — по разным положениям дейтерия в кольце). Исследования позволили заключить, что a-спираль белка ориентирована параллельно нормали мембраны, а триптофаны в 11, 13 и 15-м положениях грамицидина непосредственно участвуют в «дипольном эффекте», т. е. в прохождении заряда сквозь мембрану.
Расширяется использование дейтеро-аминокислот при изучении биосинтетических процессов высших растений. Так, с помощью введения изотопной метки в культуру клеток Asparagus officinalis (Ь-[2,3,3-В3]-фенилаланин, В,Ь-[3,3-П2]-фенилаланин) получали препараты дейтеро-аспарениола и 4-[5-(4-метоксифенокси)]-3-пентен-1-иниллфенол. Исследователи установили, что С9 атом фрагмента (- СН = СН - СН2 - О - СвН4 - О -) поступает из молекулы фенилаланина, что подтвердило устоявшееся представление о последовательности реакций биосинтеза норлигнана у этого растения.
4.2.
Еще по теме Применение низкомолекулярных индивидуальных дейтерированных БАВ в научных исследованиях:
- Использование индивидуальных дейтерированных белков и нуклеиновых кислот в научных исследованиях
- Применение дейтерированных БАВ
- Новые свойства дейтерированных аналогов БАВ
- Применение дейтерированных биологически активных клеточных структур
- Применение иных изотопных вариантов, стабильно меченных БАВ
- 57. Регуляция численности и убой животных, применение животных в научных исследованиях и учебном процессе: морально-этические и законодательные ограничения.
- Часть II Примеры применения биотехнологии БАВ в науке и производств
- Основные направления применения растений подрода Dracunculus Bess, в народной и научной медицине
- Использование в исследованиях множественно изотопно меченных БАВ
- Постмаркетинговые научные исследования
- 23. Индивидуальные схемы и их применение (цели, источники угроз валидности и т. д.).
- Этика научных исследований
- Научно-практическая значимость исследования
- 12.4 Научные исследования (R&D)
- Малые (низкомолекулярные) белки теплового шока
- Можно ли достигнуть оптимального уровня и направления исследований и научных разработок оздоровительных технологий?
- Планирование тематики научных исследований, сроков выполнения и выхода их в практику
- Исследования и научные разработки фармацевтики
- Экономика исследований и научных разработок