ГЛАВА 5. ВИРОИДЫ
Болезни, вызываемые вироидами, не имеют существенных отличий от других вирусных болезней растений. Первой из них,, привлекшей внимание вирусологов, явилась веретеновидность. клубней картофеля (BKK), позже были обнаружены болезни цитрусовых (экзокортис цитрусовых) и др.
[Diener T., 1982].. Возбудители этих болезней привлекли к себе внимание потому, что ими оказались не обычные вирусы, а сравнительнонебольшие, ковалентно замкнутые молекулы однонитевой PHK с молекулярной массой 100 000—120 000. У вироида BKK она. состоит из 359 рибонуклеотидов. Замыкание в кольцо PHK и. сложность вторичной структуры обеспечивают необычную^ устойчивость вироидов. На такой небольшой молекуле PHK не может быть закодирована даже «мелкая» белковая молекула, а лишь, может быть, короткий полипептид. На самом- деле PHK вироидов -не имеет никакого генетического кода и- даже кодонов АУГ.Естественно, ЧТО ВИрОИДЫ не имеют собственных ферментов репликации РНК, она должна осуществляться клеточными ферментными системами. Как это происходит, пока неясно,, хотя логично предположить существование репликативного интермедиата в виде матрицы РНК, комплементарной вирионной или двунитевой РНК. Такая двунитевая PHK была выделена из зараженных PSTVтоматов с помощью электрофореза в полиакриламидном геле и ДНК — РНК-гибридизации.. На циркулярной или линейной нити репликативного интермедиата обнаружены множественные нити вновь синтезируемой дочерней РНК. Таким образом, моделью репликации PHK вироидов может служить вращающийся круг [Owens R., Diener T., 1982]. Нельзя, одна'ко, исключить и другой возможно-
6Ь
сти —репликации через ДНК-интермедиат, о чем косвенно свидетельствует чувствительность ее к актиномицину D.
В этом отношении представляет определенный интерес изучение вироида болезни каданг-каданг, поражающей кокосовые пальмы на Филиппинах. При изучении этой болезни были обнаружены 4 вида низкомолекулярных РНК, состоящие из 250 и 500 нуклеотидов (ранние стадии болезни), 300 и 600 нуклеотидов (поздние стадии).
По-видимому, первые члены пар являются мономерами, вторые — димерами первых. Обнаружена высокая степень гомологии этих вироидов с другими известными вироидами (PSTV, CSV, CEV, ASDV).К ним примыкают вирусоиды —инкапсидированные вирусоподобные PHK (VTMOV, SNMY, Subterranean clover mother virus').Все они не содержат генетического кода. Предполагают, что репликация их производится клеткой через репликативный интермедиат—олигомерную PHK [Haseloff J. et al., 1982].Как уже указывалось, вторичная структура вироидов весьма сложна и включает в себя многочисленные комплементарные участки, что также делает возможным формирование димеров [Diener T., 1986]. По результатам секвенирования у вироидов предположено существование 5 доменов: консервативный центральный район, район патогенности, домен вариабельный, два терминальных домена, взаимно обменивающихся между вироидами. Реаранжировка доменов иллюстрируется на примере вироида болезни каданг-каданг кокосовой пальмы, который .появляется de novo при каждой инфекции. Этот механизм объясняет происхождение вироидов и вирусов, когда осуществляется обмен между PHK патогена и «хозяина» [Keese P. et al., 1985]. На рис. 4 и 5 показано строение доменов вироидов, приведенных в табл. 4.
Таким образом, вироиды являются автономными фрагментами (их не хочется даже назвать генами) генетического материала клеток, транскрибированного в однонитевую PHK- •Сложность их вторичной структуры обеспечивает защиту вироидов от нуклеаз и возможность молекулярной эволюции. До сих пор не ясно, что лежит в основе патогенеза вызываемых ими заболеваний. Скорее всего это не первичное свойство генетических элементов, от которых произошли вироиды, а приобретенное свойство, возможно, создавшее этим автономным структурам эколого-эволюционные преимущества.
Имеются веские основания предполагать, что вироиды происходят от интронов или транспозонов — подвижных генетических элементов. В пользу этой гипотезы свидетельствует структурное сходство вироидов и транспозонов.
При сравнении 4 вироидов— карликовости верхушки томата (TASV),экзокорти- са цитрусовых (CEV),веретеновидности клубней картофеля (PSTV),«планта махо» томата (TPMV).и задержки роста
Рис. 4. Структура вироида (схема).
Показаны 5 участков гомологии между вироидами;- стрелками показаны инвертиро* ванные повторы; 1 — левосторонний концевой участок; 2 — участок патогенности; 3 — консервативный центральный нуклеоид; 4 — вариабельный участок; 5 — правосторонний концевой участок.
Рис. 5. Вторичная структура центрального консервативного участка различных вироидов.
Объединенные последовательности консервативны во всех вироидах; 1 —PSTV. TPMV∙. 2 — CEV, TASV'3—CCCV; 4 — HSV.
хризантем (CSV) — обнаружены 5 сходных последовательностей размером 11—'15 нуклеотидов, в целом их гомология составляет 73—83%. При этом обнаружены последовательности, типичные для концов транспозонов, а также инвертированные последовательности, оканчивающиеся динуклеотидами УГ и ЦА. На основании этих данных предполагается [Kiefer М. et al., 1983], что вироиды происходят от транспозонов или ретровирусных провирусов, утративших внутренние кодирующие- области. Выдвинута гипотеза, согласно которой вироиды, представляющие собой ковалентно-замкнутые кольцевые молекулы PHK с молекулярной массой 1,1 XlO5—1,3?105, произошли в результате кольцевания отрезанных интронов. Такая модель
"Таблица 4. Вироиды и их изоляты с установленной нуклеотидной ■последовательностью
| Хозяин | Вироид | Число нуклеотидов |
| Авокадо | ASBV | 247 |
| Хризантема | CSV | 354; 356 |
| Цитрусовые | CEV | 370—375 |
| ■Орех | CCCV | 246; 247 |
| Огурец | HSV | 297; 303 |
| Картофель | PSTV | 359 |
| Томат | TASV | 360 |
| Томат | TPMV | 360 |
| ■Орех | Болезни каданг-каданг | 246, 247 |
| Авокадо | кокосовой пальмы «Солнечной» пятнисто- | 247 |
| Хризантема Картофель | сти авокадо Задержки роста хризантем Веретеновидности клуб- | 359 |
| Томат | ней картофеля Карликовости верхуш- | 360 |
| ки томата «Планта махо» томата | ||
| ■Огурец | Пожелтения плодов | 297, 303 |
| Цитрусовые | огурца Экзокортиса цитрусовых | 370—375 |
/выдвинута на основании изучения вироида веретеновидности клубней картофеля [Diener T., 1986; Dinter-Gottlieb F., 1986].
C другой стороны, вироиды по ряду свойств сближаются с !некоторыми сателлитными вирусами, а обе группы структур — с интронами ядерной и митохондриальной ДНК [Gollmer С.
vet al., 1985]. Цитированные авторы изучили сателлит кукумо- вируса — Peanut stunt Virusassociated RNA5 (PARNA5). Его линейная PHK имеет на 5'-конце кэп-структуру и на З'-конце /группу —ОН; 5'-и 3'-,концы его гомологичны PHK другого сателлита вируса мозаики гороха. При этом до 90% нуклеотидов PARNA5гомологично некоторым вироидам растений, а также некоторым интронам (рис. 6). Эти данные позволяют заключить, что PARNA5и вироиды происходят от интронов ядерной и митохондриальной ДНК и эволюционно диверги- -ровали.Сателлиты вирусов растений имеют небольшую РНК, от ■400 нуклеотидов и более, размножаются в присутствии хелпер- гвирусов групп кукумовирус, неповирус, собемовирус, томбус- вирус. РНК-сателлит вируса кольцевой пятнистости табака имеет молекулярную массу 115 000 и состоит из 352 нуклеотидов. Инкапсидир.уется только плюс-нить в мономерной или тмультимерной форме [Gerlach W. et al., 1986]. Вирус-хелпер
Рис. 6. Схематическое изображение возможного спаривания консервативных последовательностей интронов PARNA5 в сравнении с интронами митохондрий. В рамку включены консервативные последовательности.
относится к неповирусам и обеспечивает не только репликацию сателлитной РНК, но и ее инкапсидацию, причем вирус- сЬтеллит снижает патогенные свойства поддерживающего его вируса. Димерные формы PHK при автолизе образуют две активные молекулы PHК-сателлитов [Buzayan J. et al., 1986].
Наряду с вирусами-сателлитами РНК-содержащих вирусов часто «сопровождают» сателлитные PHK- Так, провирус кольцевой пятнистости табака ассоциируется с кольцевидной сателлитной РНК, которая'реплицируется основным вирусом по типу «катящегося круга» (rolling circle).Подобного рода сателлитные PHK получили обозначение вирусоидов, часто обнаруживаемых в зараженных вирусами растениях [Linthorst H., Kapar J., 1984]. Сателлитная PHK (РНК2), выявляемая в растениях, пораженных еобемовирусами, отличается от их PHK (PHKl)., которая имеет линейное строение и моб-1536
65
лекулярную массу l,4?106.
В отличие от них сателлитная PHK неболыпих размеров, обладает циркулярным строением и сходна с вироидами [Jones A., Mayo M., 1984].Вирус-сателлит некроза табака размножается в присутствии основного вируса, однако кодирует собственный капсидный белок. В то время как вирус некроза табака имеет коэффициент седиментации 130S, вирус-сателлит осаждается при 58S. Серологические белки обоих вирусов не имеют никакого родства; размер вирионов около 30 нм, сателлита— 17 нм. Сателлитная PHK имеет молекулярную массу 0,4?106, что соответствует 1200 нуклеотидам [Kassanis В., 1981]. При изучении сателлитной PHK вируса мозаики огурца была показана большая степень ее гомологии с З'-концевой частью тРНК и соответствующих генов растения [Gordon K∙, Symons R., 1983].
Выявлены своеобразные соотношения между квадрапар- титным вирусом хронического паралича пчел и его сателлитом. Их капсидные белки разные и серологически не имеют родства. Вирус хронического паралича пчел является хелпером ассоциированного с ним вируса-сателлита, не способного к самостоятельной репродукции. При совместном заражении происходит конкуренция за использование полимеразы, в связи с чем титр вируса-хелпера снижается [Ball В. et al., 1985].
Таким образом, вироиды и вирусоиды могут рассматриваться как самые начальные стадии образования автономных генетических структур, из которых впоследствии могут развиться классические вирусы. Их происхождение от клеточных генетических элементов несомненно, вместе с тем уже на этой первоначальной стадии они характеризуются автономией эволюции.
Еще по теме ГЛАВА 5. ВИРОИДЫ:
- ГЛАВА 3. КЛАССИФИКАЦИЯ ВИРУСОВ
- Глава 17 ВЫЧИСЛИТЕЛЬНЫЙ ЭКСПЕРИМЕНТ
- Система семейной поддержки (глава 19)
- Глава 1. Введение в иммунологию
- Глава 7. Этапы факоэмульсификации
- Встреча с Внутренним Наставником (глава 15)
- Глава 8. Болезни легких
- ГЛАВА 12 АНОМАЛИИ И ЗАБОЛЕВАНИЯ РОГОВИЦЫ
- ГЛАВА 6. ЭПИДЕМИОЛОГИЯ И ПРИНЦИПЫ ОРГАНИЗАЦИИ ПСИХИАТРИЧЕСКОЙ ПОМОЩИ
- Глава 6 Сопроводительная терапия в детской онкологии и гематологии
- ГЛАВА 6 ПАЛЬЦЕВАЯ ДЕРМАТОГЛИФИКА ПРИ ОГРАНИЧЕННЫХ ФИЗИЧЕСКИХ ВОЗМОЖНОСТЯХ
- Глава 3 КЛИНИКА, ДИАГНОСТИКА И ПРОГНОЗ АНДРОЛОГИЧЕСКИХ ЗАБОЛЕВАНИЙ У ДЕТЕЙ И ПОДРОСТКОВ
- Глава З Патологические состояния сетчатой оболочки, выявляемые при ультразвуковой диагностике.
- Глава 1
- Глава 1
- Глава 2
- Глава 3