АНАЛИЗ СОМАТИЧЕСКИХ МУТАЦИЙ ПРИ ОНКОЛОГИЧЕСКИХ ЗАБОЛЕВАНИЯХ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БИОЧИПОВ
Т.В. Наседкина, М.А.Емельянова, Ю.Е. Яценко, Ф.А. Амосенко, Л.Н. Любченко
ИМБ им. В.А. Энгельгардта РАН, Москва
Медико-генетический научный центр РАМН, Москва
РОНЦ им. Н.Н.Блохина РАМН, Москва
Соматические мутации в опухолевых клетках могут служить диагностическими и прогностическими маркерами, а также определять чувствительность к противораковым препаратам.
Детекция соматических мутаций в K-Ras в клетках ряда сoлидных опухолей имеет важное прогностическое значение при назначении противоопухолевой терапии. Знание статуса гена K-Ras у конкретного пациента позволяет подобрать индивидуальное лечение, увеличивая его эффективность и уменьшая риск развития токсических реакций.
Разработан биочип, позволяющий определять наиболее часто встречающиеся мутации в 12; 13 и 61 кодонах гена K-Ras . Сложность детекции соматических мутаций в биоптате опухоли заключается в резком количественном преобладании последовательностей дикого типа над мутантными.
Для подавления амплификации последовательностей дикого типа в реакционную смесь вводили специфические LNA-олигонуклеотиды. Продукты амплификации гибридизовали с олигонуклеотидными зондами, иммобилизованными на поверхности биочипа. Исследовали клинические образцы ДНК пациентов с опухолями поджелудочной железы. Мутации были обнаружены в 35 (77%) образцах из 46. Метод позволяет определять мутации при наличии 4% опухолевых клеток в образце.
Также разработаны биочипы для определения мутаций в генах NPM1 и FLT3 при гемобластозах. Исследованы 140 образцов ДНК детей, больных острым нелимфобластным лейкозом. Мутации в гене NPM1 были обнаружены у 7 (5%) из 140 пациентов.
Разработанные биочипы позволяют быстро и с высокой достоверностью определять соматические мутации в опухолевых клетках и могут быть использованы в рутинной клинической диагностике.
Работа поддержана Российским фондом фундаментальных исследований (проект № 08-04-01480).
Еще по теме АНАЛИЗ СОМАТИЧЕСКИХ МУТАЦИЙ ПРИ ОНКОЛОГИЧЕСКИХ ЗАБОЛЕВАНИЯХ С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ БИОЧИПОВ:
- Использование дискриминантного анализа для формирования групп онкологического риска при раке желудка и толстой кишки.
- Теория соматической мутации
- 3.4. Анализ шестимесячной выживаемости без прогрессирования заболевания у пациентов со злокачественными глиомами головного мозга при использовании флуоресцентной интраоперационной диагностики
- 7.9. При онкологических заболеваниях
- Какова роль семьи при хронических соматических заболеваниях у детей?
- 3. Многофакторный анализ как один из методов формирования групп повышенного онкологического риска. Использование интегральных клинико-лабораторных показателей в диагностическом мониторинге у больных раком желудка и толстого кишечника.
- ГЛАВА I. Распространенность онкологических заболеваний и состояние специализированной онкологической помощи больным в амбулаторных условиях (обзор литературы).
- Использование интегрального показателя как критерия для формирования групп онкологического риска при раке желудка и толстой кишки.
- 1.6 Взаимосвязь заболеваний пародонта с соматической патологией
- Использование монотерапии цисплатином у больных раком молочной железы и опухолью неизвестной первичной локализации с мутацией BRCA1
- Каковы внутренние психологические закономерности изменений психики больных в условиях соматического заболевания?
- 2.12. Анализ деятельности онкологических диспансеров