Выделение бактериальной ДНК
Выделение ДНК энтерококков проводили по методу R. Boom et al. (1990) с использованием гуанидинтиоцианата (GuSCN).
Таблица 2
Использованные в работе праймеры Enterococcus faecalis
| Ген | Фактор патогенности | Пары праймеров | Размер ампликона н.п. |
| 1 | 2 | 3 | 4 |
| 1 | Cylm (токсигенность) прямой праймер | 5' ACAGGGAGACTCTCATAGTCGCGG 3' | 296 |
| обратный праймер (цитолизин) | 5' CCCCGTGCCGGGGTGCCTGGACCTG 3' | ||
| 1 | 2 | 3 | 4 |
| 2 | cpd (бактериоциногенность) прямой праймер | 5' CGCGTGAAGAACAAATGGCCGC 3' | 528 |
| обратный праймер | 5' GCTTTCCTGGTAGTTGGCGTAGG 3' | ||
| 3 | cps (адгезия и колонизация) прямой праймер | 5' GGCATCGAAGCTAATGGGTGGGT 3'
| 298 |
| обратный праймер | 5' GCTTTCCTGGTAGTTGGCGTAGG 3' |
Подбор праймеров и температуры отжига осуществляли при использовании пакета программ в Gene Runner Version 3.05 и Primer Blast (ресурсы GeneBank) (США). Праймеры энтерококков были синтезированы в «ЗАО Симтол» (Москва).
Кольпоскопическое обследование больных урогенитальным хламидиозом
Осмотр влагалищной части шейки матки определялся на бинокулярном кольпоскопе фирмы «OLYMPUS-OSC-2» (Япония). Оптическая система представляет собой систему линз с фокусным расстоянием 25-28 см., имеет сменные окуляры Х 7, Х 15, Х 28, а также комплект сменных фильтров и фотокамерой. Определялась форма, величина шейки матки и наружного зева, цвет, рельеф слизистой оболочки, граница плоского эпителия, покрывающего шейку, и цилиндрического эпителия цервикального канала. Затем шейку матки обрабатывали 3% раствором уксусной кислоты. Исследование проводилось в течение ближайших 4-5 минут. После изучения кольпоскопической картины шейки, обработанной уксусной кислотой, проводилась проба Шиллера (Залуцкий И.В. и соавт., 2007). Для этого шейку матки смазывали ватным тампоном смоченным 3% раствором Люголя и в зависимости от окрашивания эпителия шейки матки выявлялись зоны патологически измененного эпителия и обозначались участки для биопсии шейки матки.
Еще по теме Выделение бактериальной ДНК:
- ПРАКТИЧЕСКОЕ ЗАНЯТИЕ № 2 Тема: Выделение ДНК из крови
- 4. Выделение ДНК из лейкоцитов.
- ПРАКТИЧЕСКОЕ ЗАНЯТИЕ №3 Тема: Выделение ДНК на сорбент из крови
- 9.4. Выделение плазмидной ДНК.
- 3. Выделение ДНК и РНК из клеточных культур.
- ПРАКТИЧЕСКОЕ ЗАНЯТИЕ №4 Тема: Выделение ДНК из мочи, секрета простаты, слюны, глазной жидкости
- ПРАКТИЧЕСКАЯ РАБОТА №5 Тема: Аплификация образцов выделенной ДНК
- 2.3 Идентификация Candida spp. методом ДНК-секвенирования
- Определение уровня ДНК бактерий
- Репликация ДНК
- 3.1 Частота хронического рецидивирующего кандидоза гениталий, рецидивирующего бактериального вагиноза и хронического рецидивирующего кандидоза гениталий в сочетании с бактериальным вагинозом