КЛАССИФИКАЦИЯ И НОМЕНКЛАТУРА ВИРУСОВ ЖИВОТНЫХ
Вирусы были открыты в конце XIX столетия (1892 г.) отечественным учёным Д.И. Ивановским на основе измерения единственной физико-химической характеристики - фильтруемости. Именно это свойство первоначально использовалось для их классификации в качестве отдельной группы микроорганизмов.
С ростом числа обнаруженных вирусов были предприняты первые попытки классификации внутри этой самостоятельной группы. В качестве критериев использовали сходство их патогенных свойств, ор- ганотропность, общность экологического статуса. Кроме того, одна из первых классификаций состояла в разделении вирусов по принципу поражения определённых хозяев, а именно: вирусы бактерий, насекомых, растений, животных и человека. При этом происходило объединение весьма различающихся, как было выяснено впоследствии, групп вирусов.
Групповые названия первых классификаций вирусов до сих пор используются в вирусологии, но они не признаны официальной классификацией и номенклатурой, хотя нередко применяются в клинических, эпизоотологических и диагностических контекстах.
К началу 50-х годов появилось множество различных классификационных схем, часто оказывающихся взаимоисключающими. По этой причине в 1966 г. на Международном микробиологическом конгрессе в Москве был учреждён Международный комитет по номенклатуре вирусов, который в 1973 г. был переименован в Международный комитет по таксономии вирусов. Комитетом опубликовано семь докладов, в последнем изложена современная универсальная система классификации и номенклатуры вирусов.
Современная классификация вирусов осуществляется по ряду признаков, главными из которых являются тип и структура нуклеиновой кислоты, стратегия вирусного генома (способ репликации), симметрия нуклеокапсида (спиральная, кубическая, смешанная), наличие или отсутствие липопротеидной оболочки. Все вирусы по своим фундаментальным признакам группируют независимо от круга естественных хозяев.
В настоящее время известно более 3600 видов вирусов позвоночных, беспозвоночных, простейших, растений, грибов, водорослей и
бактерий, из которых 1550 классифицированы и входят в 3 порядка, 56 семейств, 9 подсемейств и 233 рода. С учётом штаммов и серотипов насчитывают более 30000 вирусов.
Вирусы позвоночных входят в 28 семейств, из них 10 являются ДНК-содержащими и 18 - РНК-содержащими. В составе семейств вирусы подразделены на 7 подсемейств (покс-, герпес-, парво-, парамиксовирусы) и 85 родов, некоторые семейства включают только один род. В составе семейств 7 родов не имеют международного названия. В последнее время выделено 2 порядка, объединяющих семейства вирусов со сходной организацией генома и единой стратегией репликации. Порядок Mononegaviralesвключает семейства Paramyxoviridae, Rhabdoviridae, Filoviridae, Bornaviridae; порядок Nidovirales - Corona- viridae и Arteriviridae.Кроме того, выделены два «плавающих» рода вирусов: Deltavirusи вирусы, подобные вирусу гепатита Е.
Современная универсальная система использует иерархические уровни (таксоны), соответствующие порядку, семейству, подсемейству, роду и виду. Номенклатура по традиции состоит в том, что за словом «вирус» стоит название болезни основного хозяина, например, вирус чумы крупного рогатого скота. Название порядка оканчивается на «... virales», семейства - на «... viridae»,подсемейства - на «... virinae», рода - на «... virus».
В качестве примера традиционно приводится полная таксономия вируса вакцины: семейство Poxviridae,подсемейство Chordopox- virinae,род Orthopoxvirus,вид - вирус вакцины.
Правила номенклатуры вирусов дают определение виду, роду и семейству.
Вид - это класс вирусов, характеризующийся большим числом критериев, образующий реплицирующуюся линию и занимающий особую экологическую нишу.
Род - это группа видов с определёнными общими характеристиками, отличающимися от вирусов других родов. Критерии для выделения родов включают: феномены генетических взаимодействий, круг восприимчивых хозяев, патогенность, географическое распространение, способ передачи, антигенные свойства.
Семейство - это группа родов с общими характеристиками, отличающимися от вирусов других семейств. Критерии, используемые для деления на семейства, содержат фундаментальные свойства вирионов: тип и структуру нуклеиновой кислоты, наличие липопротеиновой оболочки, стратегию вирусного генома, размер и морфологию вирионов.
Таблица
Классификация вирусов животных
OI
| № п/п | Название возбудителя | Таксономия | Морфология | Патогенность | |
| семейство, подсемейство | род | ||||
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 |
| 1 | Возбудитель аденовирусной инфекции крупного рогатого скота | Adenoviridae | Mastadenovirus | Дс линейная ДНК, безоболочечный, икосаэдр, 70-90 нм | Крупный рогатый скот |
| 2 | Вирус инфекционного гепатита собак | То же | То же | То же | Собаки, песцы, лисы, волки, шакалы |
| 3 | Возбудитель аденовирусной инфекции кур | То же | Aviadenovirus | То же | Куры, утки |
| 4 | Вирус африканской чумы свиней | Asfaviridae | Asfavirus | Дс линейная ДНК, оболочечный, сфера, икосаэдр, 70-100 нм | Свиньи |
| 5 | Вирус болезни Ауески | Herpesviridae, Alphaherpesvirinae | Varicellovirus | Дс линейная ДНК, оболочечный, икосаэдр, 100-180 нм | С.-х. животные, пушные звери, дикие плотоядные, грызуны |
| 6 | Вирус инфекционного ринотра- хеита крупного рогатого скота | То же | То же | То же | Крупный рогатый скот |
II
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 |
| 7 | Вирус ринопнев- монии лошадей | То же | То же | То же | Лошади, ослы, мулы, пони |
| 8 | Вирус болезни Марека | То же | Род вирусов, подобных вирусу болезни Марека | То же | Куры, индейки, перепела, фазаны, утки, лебеди, куропатки |
| 9 | Вирус инфекционного ларинготрахеита птиц | То же | Род вирусов, подобных вирусу ларинготрахеита птиц | То же | Куры, фазаны, индейки |
| 10 | Вирус чумы уток | Неклассифицирован в семействе | Неклассифицирован в семействе | То же | Утки, лебеди, гуси, казарки |
| 11 | Вирус злокачественной катаральной горячки крупного рогатого скота | Herpesviridae, Gammaherpesvirinae | Phadinovirus | То же | Крупный рогатый скот, мулы, бизоны |
| 12 | Возбудитель пар- вовирусной инфекции свиней | Parvoviridae, Parvovirinae | Parvovirus | Ос линейная ДНК, безоболочечный, икосаэдр, 18-22 нм | Свиньи |
| 13 | Возбудитель пар- вовирусной инфекции собак | То же | То же | То же | Собаки, куницы, енотовидные собаки |
| 14 | Вирус алеутской болезни норок | То же | То же | То же | Норки |
12
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 |
| 15 | Вирус оспы коров | Poxviridae, Chordopoxvirinae | Orthopoxvirus | Дс линейная ДНК, оболочечный, ово- идной формы, 250-450х140-260 нм | Крупный рогатый скот, буйволы, человек |
| 16 | Вирус нодулярного дерматита крупного рогатого скота | То же | Capripoxvirus | То же | Крупный рогатый скот, буйволы, зебу |
| 17 | Вирус оспы мелкого рогатого скота | То же | То же | То же | Овцы, козы |
| 18 | Вирус контагиозного пустулёзного дерматита овец и коз | То же | Parapoxvirus | То же | То же |
| 19 | Вирус миксоматоза кроликов | То же | Leporipoxvirus | То же | Домашние и дикие кролики |
| 20 | Вирус оспы кур | То же | Avipoxvirus | То же | Куры, голуби, канарейки и др. |
| 21 | Вирус респираторного и репродуктивного синдрома свиней | Arteriviridae | Arterivirus | Ос линейная РНК, + геном, оболочечный, сфера, 45-65 нм | Свиньи |
13
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 |
| 22 | Вирус инфекционного бурсита птиц | Birnaviridae | Avibirnavirus | Дс линейная РНК, безоболочечный, икосаэдр, 55-60 нм | Куры, индюки |
| 23 | Вирус лихорадки долины Рифт | Bunyaviridae | Phlebovirus | Ос РНК, + или - геном, оболочечный, сфера или плеоморфная форма, 60-75 нм | Крупный и мелкий рогатый скот, дикие жвачные животные, грызуны, человек |
| 24 | Вирус геморрагической болезни кроликов | Caliciviridae | Lagovirus | Ос линейная РНК, + геном, безоболо- чечный, икосаэдр, 28-33 нм | Кролики |
| 25 | Вирус трансмиссивного гастроэнтерита свиней | Coronaviridae | Coronavirus | Ос линейная РНК, + геном, оболочечный, плеоморфная форма, 60-160 нм | Свиньи, собаки |
| 26 | Вирус инфекционного бронхита кур | То же | То же | То же | Куры |
| 27 | Вирус гриппа лошадей | Orthomyxoviridae | Influenzavirus A | Ос линейная РНК, - геном, оболочечный, сфера, 80-120 нм | Лошади, человек |
| 28 | Вирус гриппа свиней | То же | То же | То же | Свиньи, человек |
14
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 |
| 29 | Вирус гриппа птиц | То же | То же | То же | Семейство куриных, утки, человек |
| 30 | Вирус парагриппа крупного рогатого скота | Paramyxoviridae, Paramyxovirinae | Respirovirus | Ос линейная РНК, оболочечный, спираль, 150-300 нм | Крупный рогатый скот |
| 31 | Вирус чумы крупного рогатого скота | То же | Morbillivirus | То же | Крупный рогатый скот, зебу, буйволы, яки, верблюды, овцы, козы |
| 32 | Вирус чумы мелких жвачных | То же | То же | То же | Козы, овцы, дикие парнокопытные некоторых семейств |
| 33 | Вирус чумы плотоядных | То же | То же | То же | Собаки, песцы, хорьки, волки, лисицы, шакалы, норки, соболя и др. |
| 34 | Вирус болезни Ньюкасла | То же | Rubulavirus | То же | Куры, индейки, утки, цесарки, голуби, вороны и др. |
15
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 |
| 35 | Вирус респира- торносинцитиальной инфекции крупного рогатого скота | Paramyxoviridae, Pneumovirinae | Pneumovirus | То же | Крупный рогатый скот |
| 36 | Вирус ящура | Picornaviridae | Aphthovirus | Ос линейная РНК, + геном, безоболо- чечный, икосаэдр, 23-25 нм | Парнокопытные животные, человек |
| 37 | Вирус болезни Тешена | То же | Teshevirus | То же | Домашние и дикие свиньи |
| 38 | Вирус везикулярной болезни свиней | То же | Enterovirus | То же | То же |
| 39 | Возбудитель вирусного гепатита утят | То же | Неклассифицирован в семействе | То же | Утки |
| 40 | Вирус бешенства | Rhabdoviridae | Lyssavirus | Ос линейная РНК, - геном, оболочечный, бациллярной формы, 100-430х45-100 нм | Теплокровные животные, человек |
16
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 |
| 41 | Вирус везикулярного стоматита | То же | Vesiculovirus | То же | Лошади, крупный рогатый скот, свиньи, многочисленные виды диких мелких тропических млекопитающих, человек |
| 42 | Вирус африканской чумы лошадей | Reoviridae | Orbivirus | Дс линейная, сегментированная РНК, безоболочес- ный, икосаэдр, 70-80 нм | Лошади, мулы, ослы, зебры |
| 43 | Вирус блютанга | То же | То же | То же | Овцы |
| 44 | Вирус лейкоза крупного рогатого скота | Retroviridae | Deltaretrovirus | Ос линейная РНК, оболочечный, сфера, 80-100 нм | Крупный рогатый скот, овцы, зебу, буйволы |
| 45 | Вирус лейкоза птиц | То же | Alpharetrovirus | То же | Куры, гуси, голуби, индюки, попугаи и др. |
| 46 | Вирус инфекционной анемии лошадей | То же | Lentivirus | То же | Лошади, ослы, мулы |
17
| 1 | 2 | 3 | 4 | 5 | 6 |
| 47 | Вирусы висны- маэди овец | То же | То же | То же | Овцы, козы |
| 48 | Вирусы инфекционного энцефаломиелита лошадей | Togaviridae | Alphavirus | Ос линейная РНК, + геном, оболочечный, сфера, 20-80 нм | Лошади, ослы, мулы, птицы, человек |
| 49 | Вирус диареи крупного рогатого скота | Flaviviridae | Pestivirus | Ос линейная РНК, + геном, оболочечный, сфера, 40-60 нм | Крупный рогатый скот, буйволы, олени, косули |
| 50 | Вирус классической чумы свиней | То же | То же | То же | Свиньи,кабаны |
Примечание. Дс - двуспиральная; Ос - односпиральная; + - геном (позитивная или негативная полярность генома).
Учебное издание содержит материалы по классификации и описанию 50 вирусов, вызывающих наиболее распространённые и особо опасные инфекционные болезни животных, изучение которых предусмотрено программами «Ветеринарная вирусология» и «Эпизоотология и инфекционные болезни» для высших сельскохозяйственных учебных заведений по специальности 111201 - «Ветеринария».
В характеристике семейств, включающих описание 2 и более вирусов (Адено-, Герпес-, Парво-, Покс-, Корона-, Ортомиксо-, Парамиксо-, Пикорна-, Рабдо-, Рео-, Ретро-, Тога-, Флавивирусы), раздел «Морфология и химический состав вирусов» приводится сразу после классификации и является общим для всех представителей. Таблица «Классификация вирусов животных» включает название возбудителя, его таксономию и др.II.
Еще по теме КЛАССИФИКАЦИЯ И НОМЕНКЛАТУРА ВИРУСОВ ЖИВОТНЫХ:
- Общие сведения о вирусе папилломы человека. Классификация папилломавирусной инфекции. Пути передачи вируса.
- 1. Номенклатура и классификация поражений почек – KDIGO, 2012.
- Глава 1 Номенклатура, классификации, оценка степени сердечно-сосудистого риска
- Дядык А.И. и др.. Хронические заболевания почек: номенклатура, классификации, диагностика, вопросы ренопротекции, 2012
- Имеет ли она общее с классификацией биологических вирусов?
- Классификация компьютерных вирусов.
- Классификация памяти у животных.
- Классификация способов и аппаратов питания животных (по Йонджу, 1954)
- 3.3.2. Номенклатура SNOMED
- 57. Регуляция численности и убой животных, применение животных в научных исследованиях и учебном процессе: морально-этические и законодательные ограничения.
- ПРИЛОЖЕНИЯ 1. Международная анатомическая номенклатура и офтальмологическая терминология
- 53. Понятие о благополучии животных. Благополучие животных как морально-этическая и экономическая проблема.
- Номенклатура пухлин.
- Номенклатура и частота исследований.
- Единая номенклатура государственных и муниципальных учреждений здравоохранения
- Приложение 1 Приказ МЗ РФ № 337 от 27. 09. 1999 г. Номенклатура (классификатор)
- Глава 2. Онкологическая номенклатура и общие принципы гистологической диагностики опухоли
- Семейство Артеривирусов (от греч. arteria- артерия) состоит из 1 рода - Arterivirus(от греч. arteria- артерия): вирусы артериита лошадей*, респираторного и репродуктивного синдрома свиней и др. (4 вируса).