AUXACOLOR 2
Всего изучено 322 штамма Candida spp., выделенные от больных с ИК.
По результатам видовой идентификации методом MALDI-TOF масс-
спектрометрии выявлено, что исследуемые штаммы принадлежали к 14
видам грибов рода Candida: C.
albicans – 139 (43,2%), C. parapsilosis – 65 (20,2%), C. glabrata – 37 (11,5%), C. tropicalis – 31 (9,6%), C. krusei – 20 (6,2%), C. guilliermondii – 17 (5,3%), C. lusitaniae – 4 (1,3%), C. pararugosa – 2 (0,6%), C. dubliniensis – 2 (0,6%), C. inconspicua – 1 (0,3%), C. bracarensis– 1 (0,3%), C. utilis- 1 (0,3%), C. kefyr – 1 (0,3%), C. lipolytica – 1 (0,3%).
Таким образом, методом MALDI-TOF масс-спектрометрии, определено, что
43,2% клинических изолятов принадлежат к C. albicans, и 56,8% являются представителями C. не-albicans видов, а среди часто встречающихся штаммов C. не-albicans видов, выявлены также и более редкие виды - C. utilis, C. pararugosa и C. inconspicua (рисунок 8).
0.6 0.3 0.3
6.2 5.3
0.6
1.3
0.3
0.3
0.3
43.2
9.6
11.5





20.2
| C. albicans | C. parapsilosis | C. glabrata |
| C. tropicalis | C. krusei | C. guilliermondii |
| C. lusitaniae C. inconspicua | C. pararugosa C. bracarensis | C. dubliniensis C. utilis |
| C. kefyr | C. lipolytica |







Рисунок 8 – Видовой спектр Candida spp., определенный методом MALDI- TOF масс-спектрометрией (n=322).
С помощью тест-системы AUXACOLOR2 среди 322 исследуемых штаммов - возбудителей ИК идентифицировали 11 видов грибов рода Candida: C. albicans – 134 (41,6%), C. parapsilosis - 65 (20,2%), C. glabrata –
35 (10,9%), C.tropicalis –29 (9,0%), C.krusei –20 (6,2%), C.guilliermondii –16 (5,0%), C. dubliniensis –13 штаммов (4,0%), C.lusitaniae –3 штамма (0,9%), C.rugosa –2 (0,6%), C.kefyr –1 (0,3%), C.lipolytica – 1 (0,3%). Для двух
штаммов видовая принадлежность неопределена (0,6%).
9
10.9
6.2 5 4
0.9 0.6 0.3
0.3
0.6
41.6



20.2
| C. albicans | C. parapsilosis | C. glabrata | C. tropicalis |
| C. krusei C. rugosa | C. guilliermondii C. kefyr | C. dubliniensis C. lipolytica | C. lusitaniae Candida spp. |







Рисунок 9 – Видовая идентификация Candida spp. с помощью тест-системы
AUXACOLOR 2 (n=322).
При сравнении полученных результатов видовой идентификации 322 штаммов совпадение составило 93,2%, (таблица 10 и 11), у C. albicans (139) доля неверной идентификации была - 7,9%, среди C.не- albicans видов - 6,0%.
Таблица 10 – Сравнение результатов идентификации возбудителей ИК тест-
системой AUXACOLOR2
| MALDI-TOF MС | AUXACOLOR 2 | |
| Верная ИД | Неверная ИД | |
| C. albicans (139) | 128 | 11 |
| C. parapsilosis (65) | 64 | 1 |
| C. glabrata (37) | 35 | 2 |
| C. tropicalis (31) | 29 | 2 |
| C. krusei (21) | 20 | 1 |
| C. guilliermondii (17) | 16 | 1 |
| MALDI-TOF MС | AUXACOLOR 2 | |
| Верная ИД | Неверная ИД | |
| C. lusitanie (4) | 3 | 1 |
| C. pararugosa 2 | 0 | 2 |
| C. bracarensis (1) | 0 | 1 |
| C. dubliniensis 2 | 2 | 0 |
| C. lipolytica (1) | 1 | 0 |
| C. kefyr (1) | 1 | 0 |
| C. inconspicua (1) | 0 | 1 |
| C. utilis (1) | 0 | 1 |
| Всего (322) (%) | 300 (93,2%) | 22 (6,8%) |
Таблица 11 – Причины расхожения результатов видовой идентификации
| MALDI-TOF MС | AUXACOLOR 2 | Причины |
| C. parapsilosis (1) | C. guilliermondii (1) | AUX: ассимиляция в лунке в целлобиозой |
| C. bracarensis (1) | C. glabrata (1) | Идентифицируется только молекуляр- но – генетическими методами |
| C. tropicalis (2) | C. albicans (2) | AUX: ошибка тест-системы |
| C. pararugosa (2) | C. rugosa (2) | Идентифицируется только молекуляр- но – генетическими методами |
| C. krusei (1) | C. albicans (1) | AUX: ошибка тест |
| C. glabrata (1) | C. guilliermondii (1) | AUX: ошибка тест |
| C. inconspicua (1) | Candida spp. (1) | Идентифицируется только молекуляр- но – генетическими методами |
| C. utilis (1) | Candida spp. (1) | Идентифицируется только молекулярно- генетическими методами |
| C. albicans (11) | (11) C. dubliniensis | AUX: ошибка тест-системы |
При сравнении полученных данных с использованием тест-системы AUXACOLOR 2 и метода MALDI-TOF масс-спектрометрии достоверных различий между ними выявлено не было (рисунок 10). Вследствии выхода тест-системы AUXACOLOR 2 за пределы допустимой ошибки, для видовой идентификации, особенно, C.не- albicans видов лучше использовать метод MALDI-TOF масс-спектрометрии, в связи с тем, что именно среди этих видов постоянно появляются штаммы со сниженной чувствительностью к противогрибковым препаратам.
Рисунок 10 – Сравнение данных полученных методами MALDI-TOF масс-
спектрометрии и AUXACOLOR 2
Таким образом, можно заключить, что использование современных методов видовой идентификации (ДНК-секвенирование и MALDI-TOF масс- спектрометрия) помогает точнее установить этиологию внутрибольничного инвазивного кандидоза в России (рисунок 11): 43,2% C.
albicans и другие
виды Candida spp. - 56.8%.
6.2 5.3
0.6
1.3
0.6 0.3 0.3
0.3
0.3
0.3
43.2
9.6
11.5





20.2
| C. albicans | C. parapsilosis | C. glabrata |
| C. tropicalis | C. k rusei | C. guilliermondii |
| C. lusitaniae C. inconspicua | C. pararugosa C. bracarensis | C. dubliniensis C. utilis |
| C. k efyr | C. lipolytica |







Рисунок 11 – Cпектр возбудителей внутрибольничного ИК в РФ (n=322)
Также был рассмотрен спектр Candida spp. в различных биосубстратах
(рисунки 12 и 13)
45
40 38.8
35
30
25 22.3
%
20
15
10
5





0
11.6 11.2
6 5.2







1.5 0.7 0.7 0.4 0.4 0.4 0.4 0.4



Рисунок 12 – Спектр Candida spp., выделенных их крови.
Следует отметить, что в крови в качестве возбудителя ИК, преимущественно изолировали C. не-albicans виды – 61,2%, в том числе C. krusei (природно устойчивый к флуконазолу вид) – 6%, а также редкие виды (4,9%). В других биосубстратах (перитонеальная и плевральная жидкости, желчь, ЦСЖ) доминировали C. albicans, в биоптатах с одинаковой частотой выделяли C. albicans и C. glabrata.
Таким образом, анализируя данные видового спектра Candida spp., было обнаружено, что среди 268 штаммов, выделенных из крови преобладали C. не-albicans виды (р=0,008), а среди 54 штаммов, выделенных из других биосубстратов - C. albicans (р=0,013).

80 75
70
60
50
%
40
30
20
Перитонеальная жидкость (n=24)
8.3
10
0
8.3 4.2
4.2
C. albicans C. glabrata C. krusei C. parapsilosis
C. tropicalis
45
40
35
30
% 25
20
15
10
5
0
Биоптаты (n=5)
40 40
20
60
50
40
% 30
20
10
0
Плевральная жидкость (n=6)
50
33.3
16.7



C. albicans C. glabrata C. krusei
C. albicans C. guilliermondii
C. parapsilosis
80
70
60
% 50
40
30
20
10
0
Желчь (n=4)
75
25
ЦСЖ (n=6)


90 83.3
80
70
60
50
%
40
30
20
10
0
16.7



C. albicans C. glabrata
C. albicans C. guilliermondii
Содержимое абсцессов (n=8)
40
35
30
25
% 20
15
10
5
0
37.5
25 25
12.5
C. parapsilosis C. albicans C. glabrata C. krusei
Рисунок 13 – Видовой спектр Candida spp., выделенный из других в норме стерильных биосубстратах.
Еще по теме AUXACOLOR 2:
- Атибактеріальна та протигрибкова терапія в педіатрії: Навчально-практичний посібник 11 видання / За ред. проф. В.В. Бережного. - Хмельницький,2016. - 416 с., 2016
- ТЕМА № 31 ГЕНЕРАЛИЗОВАННЫЕ ПОСЛЕРОДОВЫЕ ИНФЕКЦИОННЫЕ ЗАБОЛЕВАНИЯ ЛАКТАЦИОННЫЙ МАСТИТ СЕПТИЧЕСКИЙ ШОК В АКУШЕРСТВЕ
- ТЕМА № 30 ГНОЙНО-ВОСПАЛИТЕЛЬНЫЕ ПОСЛЕРОДОВЫЕ ЗАБОЛЕВАНИЯ
- ТЕМА № 29 НЕПРАВИЛЬНОЕ ПОЛОЖЕНИЕ ПЛОДА ОПЕРАЦИИ, ИСПРАВЛЯЮЩИЕ ПОЛОЖЕНИЯ ПЛОДА. АКУШЕРСКИЕ ПОВОРОТЫ ИЗВЛЕЧЕНИЕ ПЛОДА ЗА ТАЗОВЫЙ КОНЕЦ
- ТЕМА № 28 ПЛОДОРАЗРУШАЮЩИЕ ОПЕРАЦИИ МАЛЫЕ АКУШЕРСКИЕ ОПЕРАЦИИ
- ТЕМА № 27 АКУШЕРСКИЕ ЩИПЦЫ И ВАКУУМ-ЭКСТРАКЦИЯ
- ТЕМА № 26 КЕСАРЕВО СЕЧЕНИЕ
- ТЕМА № 25 АНОМАЛИИ РОДОВЫХ СИЛ
- ТЕМА № 24 ПЕРЕНАШИВАНИЕ БЕРЕМЕННОСТИ ПРЕЖДЕВРЕМЕННЫЕ РОДЫ
- ТЕМА № 23 ИММУНОЛОГИЧЕСКАЯ НЕСОВМЕСТИМОСТЬ МЕЖДУ МАТЕРЬЮ И ПЛОДОМ (на примере Rh-сенсибилизации и Rh-конфликта
- ТЕМА № 22 РОДОВОЙ ТРАВМАТИЗМ МАТЕРИ